NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Parkin proteinini kodlayan park2'deki Missense mutasyonları, otozomal resesif çocuk Parkinson hastalığının (ARJP) yaklaşık% 50'sini oluşturur. Parkin, Pael-R ve synphillin-1 gibi proteinlerin ubiquitin aracılı bozunması ve kaçakçılığında yer alan RBR (RING-between-RING) E3 ligaz ailesine aittir. Parkin'in önerilen mimarisi, büyük ölçüde dizi benzerliği çalışmalarına dayanarak, N-terminal ubikuitin benzeri ve C-terminal RBR etki alanlarından oluşur. Bu etki alanları, tanınabilir alan yapısına sahip olmayan yaklaşık 160 residue benzersiz parkin dizisi ile ayrılır. Eşsiz parkin alan dizisi içinde yeni bir alan (RING0) tanımlamak için bakteriyel olarak ifade edilen ve saflaştırılmış parkin üzerinde sınırlı proteoliz deneyleri kullandık. RING0, Cys(150)-Cys(169) ve Cys(196)-His(215) arasındaki iki ayrı, korunmuş siste-zengin kümeden oluşur ve CX(2)-(3)CX(11)CX(2)C ve CX(4-6)CX(10-16)-CX(2)(H/C) motiflerinden oluşur. Bu bölgedeki sistein / histidin kalıntılarının pozisyonları, parkin RING1 ve RING2 alan adlarının yanı sıra diğer E3 ligaz RING alan adlarıyla benzerlik taşır. Bununla birlikte, parkin'de 26 residue linker bölgesi, diğer RING alan yapılarının tipik olmayan motiflerini ayırır. Ayrıca, RING0 alan adı, parkin'in ubiquitin benzeri ve RBR bölgeleri arasındaki bilinen ARJP mutasyon alanlarından birini içerir. Elektrospray iyonizasyon kütle spektrometrisi ve endüktif olarak birleştirilmiş plazma-atomik emisyon spektrometrisi analizini kullanarak, RING0, RING1, IBR ve RING2 etki alanlarının her birinin iki Zn(2+) iyonunu bağladığını, E3 ligazının sekiz metal iyonunu bağlama kabiliyetine sahip ilk gözlemini belirledik. Çinkonun parkinden çıkarılması, proteinin neredeyse tamamen açılmasına neden olur, bu, hücresel inklüzyonlar oluşturan ve / veya ubiquitinasyon için kusurlu olan RING0 (C212Y) dahil olmak üzere parkin boyunca bulunan sistein bazlı ARJP mutasyonlarını rasyonelleştiren bir gözlemdir. Parkin'deki RING0 etki alanının tanımlanması, ARJP mutasyonlarının rollerinin değerlendirilmesinde ve hastalığı anlamayı amaçlayan deneylerin tasarlanmasında önemli olacak protein için yeni bir genel etki alanı yapısı sağlar.
Özgün kaynak özetini okuyun
Missense mutations in park2, encoding the parkin protein, account for approximately 50% of autosomal recessive juvenile Parkinson disease (ARJP) cases. Parkin belongs to the family of RBR (RING-between-RING) E3 ligases involved in the ubiquitin-mediated degradation and trafficking of proteins such as Pael-R and synphillin-1. The proposed architecture of parkin, based largely on sequence similarity studies, consists of N-terminal ubiquitin-like and C-terminal RBR domains. These domains are separated by a approximately 160-residue unique parkin sequence having no recognizable domain structure. We used limited proteolysis experiments on bacterially expressed and purified parkin to identify a new domain (RING0) within the unique parkin domain sequence. RING0 comprises two distinct, conserved cysteine-rich clusters between Cys(150)-Cys(169) and Cys(196)-His(215) consisting of CX(2)-(3)CX(11)CX(2)C and CX(4-6)CX(10-16)-CX(2)(H/C) motifs. The positions of the cysteine/histidine residues in this region bear similarity to parkin RING1 and RING2 domains, as well as other E3 ligase RING domains. However, in parkin a 26-residue linker region separates the motifs, which is not typical of other RING domain structures. Further, the RING0 domain includes all but one of the known ARJP mutation sites between the ubiquitin-like and RBR regions of parkin. Using electrospray ionization mass spectrometry and inductively coupled plasma-atomic emission spectrometry analysis, we determined that the RING0, RING1, IBR, and RING2 domains each bind two Zn(2+) ions, the first observation of an E3 ligase with the ability to bind eight metal ions. Removal of the zinc from parkin causes near complete unfolding of the protein, an observation that rationalizes cysteine-based ARJP mutations found throughout parkin, including RING0 (C212Y) that form cellular inclusions and/or are defective for ubiquitination likely because of poor zinc binding and misfolding. The identification of the RING0 domain in parkin provides a new overall domain structure for the protein that will be important in assessing the roles of ARJP mutations and designing experiments aimed at understanding the disease.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.