NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
BackgroundDJ-1, oksidatif hakaretlere karşı nöronal hücresel savunma mekanizmasının bir parçasını oluşturur, çünkü kendi kendini oksitleme yeteneğine sahiptir. Oksidatif stres, Alzheimer hastalığı ve Parkinson hastalığı (PD) dahil olmak üzere farklı nörodejeneratif bozukluklarda merkezi sinir sistemi hasarının patogenezinde yer almıştır. DJ-1 (PARK7) genindeki çeşitli mutasyonların otozomal resesif PD formuna neden olduğu gösterilmiştir. Bu çalışmada Güney Afrika PD hastaları DJ-1'deki mutasyonlar için tarandı ve bir hastada tanımlanan 16 bp silme varyantının fonksiyonel önemini araştırmayı amaçladık.MetodlarDelesyonun promotör aktivitesi üzerindeki olası etkisi, Çift Luciferaz Muhabir testi kullanılarak araştırıldı. 16 bp silmeyi çevreleyen diziyi içeren DJ-1 5'-UTR bölgesi bir pGL4.10-Temel lusiferaz-reporter vektörüne klonlandı ve HEK293 ve BE(2)-M17 nöroblastoma hücrelerine transfect edildi. Hidrojen peroksit kaynaklı oksidatif stres koşulları altında promoter aktivitesi de araştırılmıştır. DJ-1 promotör dizisinin hesaplamalı (silikoda) cis-düzenleyici analizi transkripsiyon faktörü bağlayıcı site veritabanı, PATCH ve RPISTA platformları üzerinden TRANSFAC kullanılarak gerçekleştirildi.ResultsA novella 16 bp silme varyantı (g.-6_+10del) transkripsiyon başlangıç sitesini kapsayan ve Sp1 sitesinden 93 bp 3' olarak yer alan DJ-1'te tanımlanmıştır. Silinme, HEK293 hücrelerinde yaklaşık %47, BE(2)-M17 hücrelerinde ise %60 oranında lusiferaz aktivitesinin vahşi tipe kıyasla azalmasına neden oldu (P SonuçBu, transkript stabilitesini veya çeviri verimliliğini etkileme potansiyeline sahip fonksiyonel bir DJ-1 promotör varyantının ilk raporudur. G.-6_+10del varyantının DJ-1 promotörünün normal işlevini ne ölçüde etkilediğini ve bu varyantın PD için bir risk verip vermediğini belirlemek için daha fazla çalışma gereklidir.
Özgün kaynak özetini okuyun
BackgroundDJ-1 forms part of the neuronal cellular defence mechanism against oxidative insults, due to its ability to undergo self-oxidation. Oxidative stress has been implicated in the pathogenesis of central nervous system damage in different neurodegenerative disorders including Alzheimer's disease and Parkinson's disease (PD). Various mutations in the DJ-1 (PARK7) gene have been shown to cause the autosomal recessive form of PD. In the present study South African PD patients were screened for mutations in DJ-1 and we aimed to investigate the functional significance of a novel 16 bp deletion variant identified in one patient.MethodsThe possible effect of the deletion on promoter activity was investigated using a Dual-Luciferase Reporter assay. The DJ-1 5'-UTR region containing the sequence flanking the 16 bp deletion was cloned into a pGL4.10-Basic luciferase-reporter vector and transfected into HEK293 and BE(2)-M17 neuroblastoma cells. Promoter activity under hydrogen peroxide-induced oxidative stress conditions was also investigated. Computational (in silico) cis-regulatory analysis of DJ-1 promoter sequence was performed using the transcription factor-binding site database, TRANSFAC via the PATCH and rVISTA platforms.ResultsA novel 16 bp deletion variant (g.-6_+10del) was identified in DJ-1 which spans the transcription start site and is situated 93 bp 3' from a Sp1 site. The deletion caused a reduction in luciferase activity of approximately 47% in HEK293 cells and 60% in BE(2)-M17 cells compared to the wild-type (P ConclusionThis is the first report of a functional DJ-1 promoter variant, which has the potential to influence transcript stability or translation efficiency. Further work is necessary to determine the extent to which the g.-6_+10del variant affects the normal function of the DJ-1 promoter and whether this variant confers a risk for PD.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.