NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc0
Parkinson hastalığı (PD) hem ailesel hem de sporadik formlarda ortaya çıkar ve hem monojenik hem de karmaşık genetik faktörler tanımlanmıştır. Erken başlangıçlı PD (EOPD) özellikle otozomal resesif (AR) mutasyonlarla ilişkilidir ve AR hastalığına yol açan mutasyonları taşıyan üç gen, PARK2, PARK7 ve PINK1 bulunmuştur. Bu genlerdeki mutasyonlar, EOPD hastalarının %10'undan daha azını oluşturduğundan, homozigozitenin uzatılmış koşularında ortaya çıkabilecek bu bozukluğa daha fazla çekinik genetik faktörün dahil olduğunu varsaydık.1,445 EOPD vakasında ve 6,987 kontrolde homozigozitenin (ROH) uzatılmış koşularını aramak için genom geniş SNP genotipleme yaptık. Lojistik regresyon analizleri, kontrollere kıyasla EOPD vakalarında genomik homozigozite düzeyinin arttığını göstermiştir. Bu farklılıklar, ROH taşıyan vakaların oranında üç kattan fazla bir artış olduğu 9 Mb ve üstü ROH için daha büyüktür. Bu farklılıklar, mevcut lokustaki okült resesif mutasyonlarla açıklanmamaktadır. Lojistik regresyon analizlerinde genom geniş homozigozite kontrolü, vakalar ve kontroller arasındaki farkları artırdı ve EOPD vakalarında ROH'ların sadece genom geniş melezleme önlemleriyle ilgili olmadığını gösterdi. Kromozom 19p13.3 üzerindeki bir lokustaki homozigozite, kontrollere kıyasla EOPD vakalarında daha yaygın olduğu tespit edilmiştir. Bu lokus içindeki genlerin ve tahmin edilen transkriptlerin sıralı analizi, kohortumuzda EOPD'ye neden olan yeni bir mutasyonu tanımlamayı başaramadı. ROH'lardaki bir artışla ölçülen EOPD'de genom geniş homozigozite oranı artmıştır. Bu ROH'lar, akrabalığın bir imzasıdır ve hastalığa neden olan genetik varyantları barındırmaz. Kromozom 19p13.3 dışında başka ilgi alanları da olsa, bu analizle onları tespit etme gücümüz yok.
Özgün kaynak özetini okuyun
Parkinson's disease (PD) occurs in both familial and sporadic forms, and both monogenic and complex genetic factors have been identified. Early onset PD (EOPD) is particularly associated with autosomal recessive (AR) mutations, and three genes, PARK2, PARK7 and PINK1, have been found to carry mutations leading to AR disease. Since mutations in these genes account for less than 10% of EOPD patients, we hypothesized that further recessive genetic factors are involved in this disorder, which may appear in extended runs of homozygosity.We carried out genome wide SNP genotyping to look for extended runs of homozygosity (ROHs) in 1,445 EOPD cases and 6,987 controls. Logistic regression analyses showed an increased level of genomic homozygosity in EOPD cases compared to controls. These differences are larger for ROH of 9 Mb and above, where there is a more than three-fold increase in the proportion of cases carrying a ROH. These differences are not explained by occult recessive mutations at existing loci. Controlling for genome wide homozygosity in logistic regression analyses increased the differences between cases and controls, indicating that in EOPD cases ROHs do not simply relate to genome wide measures of inbreeding. Homozygosity at a locus on chromosome19p13.3 was identified as being more common in EOPD cases as compared to controls. Sequencing analysis of genes and predicted transcripts within this locus failed to identify a novel mutation causing EOPD in our cohort.There is an increased rate of genome wide homozygosity in EOPD, as measured by an increase in ROHs. These ROHs are a signature of inbreeding and do not necessarily harbour disease-causing genetic variants. Although there might be other regions of interest apart from chromosome 19p13.3, we lack the power to detect them with this analysis.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.