NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
MikroRNA'lar (miRNA'lar), çoklu hedef genlerinin anahtar post transkripsiyonel düzenleyicileridir. Bununla birlikte, Parkinson hastalığında miRNA ekspresyonunun ayrıntılı profili, dünya çapında en yaygın ikinci nörodejeneratif hastalık ve ilk motor bozukluk henüz grafiklenmemiştir. Burada, kapsamlı miRNA profillemesini yeni nesil küçük-RNA dizilemesi ile bildiriyoruz, Parkinson hastalığı hastalarında derin beyin stimülasyonu (DBS) tedavisinden önce ve sonra lökosit RNA'sını sorgulayan ekson dizileri ve eşleştirilmiş sağlıklı kontrol gönüllüleri (HC) ile birlikte. RNA-Seq analizinde kan lökositlerinde ifade edilen 254 miRNA ve 79 yolcu iplik formu tespit edildi, bunların 16'sı HC'ye kıyasla tedavi öncesi hastalarda değiştirildi. 11 miRNA, beyin uyarımının ardından değiştirildi ve bunların 5'i hastalığa bağlı değişikliklere ters olarak değiştirildi. Stimülasyonun kesilmesi, 11 miRNA'da daha fazla değişikliklere neden oldu. Transkript izoform bolluk analizi, 47 PD'lik beyin transkriptomlarını sınıflandıran ve bağımsız mikroarrayları kontrol eden HC'ye kıyasla hastalarda 332 değişen izoform elde etti. Fonksiyonel zenginleştirme analizi mitokondrion organizasyonunu vurguladı. DBS, ubiquitin homeostasis ile zenginleştirilmiş 155 ek değişiklik indükledi. Hücresel bileşim analizi, tedavi öncesi ve sonrası bağışıklık hücresi aktivitesini ortaya çıkardı. Genel olarak, 217 hastalık ve 74 tedavi alternatif izoformları, hem 3' hem de 5' çevrilmemiş uçlar ve kodlama dizilimi siteleri içindeki değiştirilmiş miRNA'lar tarafından tahmin edilebilir bir şekilde hedeflenmiştir. Uyarım kaynaklı ağ, hastalık ağının 4 miRNA'sını ve 7 transkriptini sürdürmüştür. Sunulan dinamik ağların hastalık ve tedaviye bağlı terapötik hedefleri tanımlamak için yeni bir yol sağladığına inanıyoruz. Dahası, bu ağların tanımlanması nörolojik ve nörodejeneratif hastalıkların moleküler temelini anlamak ve beyin uyarımının insan hastalıkları üzerindeki etkisinin değerlendirilmesi için yolda atılmış önemli bir adımdır.
Özgün kaynak özetini okuyun
MicroRNAs (miRNAs) are key post transcriptional regulators of their multiple target genes. However, the detailed profile of miRNA expression in Parkinson's disease, the second most common neurodegenerative disease worldwide and the first motor disorder has not been charted yet. Here, we report comprehensive miRNA profiling by next-generation small-RNA sequencing, combined with targets inspection by splice-junction and exon arrays interrogating leukocyte RNA in Parkinson's disease patients before and after deep brain stimulation (DBS) treatment and of matched healthy control volunteers (HC). RNA-Seq analysis identified 254 miRNAs and 79 passenger strand forms as expressed in blood leukocytes, 16 of which were modified in patients pre-treatment as compared to HC. 11 miRNAs were modified following brain stimulation 5 of which were changed inversely to the disease induced changes. Stimulation cessation further induced changes in 11 miRNAs. Transcript isoform abundance analysis yielded 332 changed isoforms in patients compared to HC, which classified brain transcriptomes of 47 PD and control independent microarrays. Functional enrichment analysis highlighted mitochondrion organization. DBS induced 155 splice changes, enriched in ubiquitin homeostasis. Cellular composition analysis revealed immune cell activity pre and post treatment. Overall, 217 disease and 74 treatment alternative isoforms were predictably targeted by modified miRNAs within both 3' and 5' untranslated ends and coding sequence sites. The stimulation-induced network sustained 4 miRNAs and 7 transcripts of the disease network. We believe that the presented dynamic networks provide a novel avenue for identifying disease and treatment-related therapeutic targets. Furthermore, the identification of these networks is a major step forward in the road for understanding the molecular basis for neurological and neurodegenerative diseases and assessment of the impact of brain stimulation on human diseases.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.