Rare variants in LRRK1 and Parkinson's disease.

Araştırma özeti

Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by

Parkinson hastalığı (PD) olan bireylerin yaklaşık %20'si olumlu bir aile öyküsü rapor etmektedir. Yine de, nedensel ve hastalık değiştirici varyantların büyük bir kısmı hala bilinmemektedir. 15 potansiyel nedensel varyantı tanımlamak için geç başlangıçlı PD'li bir aileden etkilenen iki bireyde exome dizilimini kullandık. 862 PD vakasında ve 1.014 etnik olarak eşleştirilmiş kontrolde segregasyon analizi ve frekans değerlendirmesi, EEF1D ve LRRK1'deki varyantları en iyi adaylar olarak vurguladı. 862 vakada ve 1.014 kontrolde bu genlerin kodlama bölgelerinin mutasyon taraması, her iki gende de vaka ve kontrollerde birkaç yeni eşanlamlı olmayan varyant ortaya çıkardı. İşlevsel takip için LRRK1'de tanımlanmış varyantları önceliklendirmek için silico çok modelli biyoinformatik analizinde kullanıldı. Bununla birlikte, protein ekspresyonu, hücre altı lokalizasyonu ve hücre canlılığı tanımlanmış varyantlardan etkilenmemiştir. LRRK1'deki varyantların gerçekten PD'nin nedenselliği olduğu kesin olarak kanıtlanmasa da, verilerimiz PD'nin genetik temellerinde LRRK2'ye ek olarak LRRK1 için olası bir rolü güçlendirir, ancak aynı zamanda otozomal baskın veya karmaşık kalıtım kalıplarına sahip hastalıklarda yeni nesil dizileme ile tanımlanan nadir varyantların çalışmasında karşılaşılan zorlukları vurgular.

Özgün kaynak özetini okuyun

Approximately 20 % of individuals with Parkinson's disease (PD) report a positive family history. Yet, a large portion of causal and disease-modifying variants is still unknown. We used exome sequencing in two affected individuals from a family with late-onset PD to identify 15 potentially causal variants. Segregation analysis and frequency assessment in 862 PD cases and 1,014 ethnically matched controls highlighted variants in EEF1D and LRRK1 as the best candidates. Mutation screening of the coding regions of these genes in 862 cases and 1,014 controls revealed several novel non-synonymous variants in both genes in cases and controls. An in silico multi-model bioinformatics analysis was used to prioritize identified variants in LRRK1 for functional follow-up. However, protein expression, subcellular localization, and cell viability were not affected by the identified variants. Although it has yet to be proven conclusively that variants in LRRK1 are indeed causative of PD, our data strengthen a possible role for LRRK1 in addition to LRRK2 in the genetic underpinnings of PD but, at the same time, highlight the difficulties encountered in the study of rare variants identified by next-generation sequencing in diseases with autosomal dominant or complex patterns of inheritance.

Bilimsel değerlendirme

Araştırma sorusu

Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.

Yöntem ve örneklem

Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.

Temel bulgular

Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.

Sınırlılıklar

Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.

Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.