NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Progresif supranükleer palsi, hiperfosforilatlı tau proteininden oluşan karakteristik nörofibriler patolojiye sahip nadir bir parkinson bozukluğudur. Mikrotübül ilişkili protein tau genini (MAPT) tanımlayan ortak varyasyon H1 haplotipi, hastalık riskine güçlü bir şekilde katkıda bulunur. Yakın zamanda yapılan genom çapında bir ilişki çalışması (GWAS), sırasıyla STX6, EIF2AK3 ve MOBP'yi içeren 1, 2 ve 3 kromozomlarında 3 yeni risk lokusu ortaya çıkardı. Bununla birlikte, genetik çağrışımlar nadiren ilgili fonksiyonel alelin doğrudan tanımlanmasına yol açar. Daha sık olarak, kodlama değişikliği olabilecek veya gen ekspresyonu düzenleyici motiflerini etkileyebilecek nedensel polimorfizm(ler) ile bağlantı dengesizliğindedirler. Bu tür değişiklikleri tanımlamak için, progresif supranükleer palsi vakalarındaki çağrışımlar tarafından doğrudan dahil edilen bu genlerin tüm kodlama ekonlarını sıraladık ve risk lokusu 1 Mb içinde ekspresyon nicel özellik lokusu tanımlamak için kontrol beyinlerinden bölgesel gen ekspresyon verilerini analiz ettik. Derneklerin altında yatan herhangi bir kodlama varyantı bulmamış olsak da, bu lokustaki GWAS ile ilişkili tek nükleotitli polimorfizmler, ilgili genlerle tamamen örtüşen haplotiplerle tam bir bağlantı dengesizliği içindedir. EIF2AK3 ve MOBP'nin iması tam olarak değerlendirilemese de, GWAS tek nükleotidli polimorfizm rs1411478 (STX6)'nin risk alelinin taşıyıcılarında beyaz maddede STX6'nın önemli ölçüde daha düşük ekspresyonuna sahip güçlü bir ifade nicel özellik lokusu olduğunu gösteriyoruz.
Özgün kaynak özetini okuyun
Progressive supranuclear palsy is a rare parkinsonian disorder with characteristic neurofibrillary pathology consisting of hyperphosphorylated tau protein. Common variation defining the microtubule associated protein tau gene (MAPT) H1 haplotype strongly contributes to disease risk. A recent genome-wide association study (GWAS) revealed 3 novel risk loci on chromosomes 1, 2, and 3 that primarily implicate STX6, EIF2AK3, and MOBP, respectively. Genetic associations, however, rarely lead to direct identification of the relevant functional allele. More often, they are in linkage disequilibrium with the causative polymorphism(s) that could be a coding change or affect gene expression regulatory motifs. To identify any such changes, we sequenced all coding exons of those genes directly implicated by the associations in progressive supranuclear palsy cases and analyzed regional gene expression data from control brains to identify expression quantitative trait loci within 1 Mb of the risk loci. Although we did not find any coding variants underlying the associations, GWAS-associated single-nucleotide polymorphisms at these loci are in complete linkage disequilibrium with haplotypes that completely overlap with the respective genes. Although implication of EIF2AK3 and MOBP could not be fully assessed, we show that the GWAS single-nucleotide polymorphism rs1411478 (STX6) is a strong expression quantitative trait locus with significantly lower expression of STX6 in white matter in carriers of the risk allele.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.