NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
MC1R genlerinde CDKN2A ve/veya kırmızı saç rengi varyantlarındaki germline mutasyonları, deride melanom veya melanom dışı cilt kanseri gelişimi için artan duyarlılıkla ilişkilidir. CDKN2A germinal mutasyon p.G101W ve MC1R varyantlarının gen ekspresyonu ve cilt kanseri ile ilişkili transkripsiyon profilleri üzerindeki etkisini inceledik. Bu amaçla, melanom eğilimli aile bireylerinin kardeşlerinden daha sonra ifade dizisi yaklaşımı kullanılarak analiz edilen birincil cilt hücresi ko-kültürlerini kurduk. Sonuç olarak, 1535 transkriptlerinin CDKN2A mutasyona uğramış hücrelerde, bağışıklıkla ilgili genlerin (HLA-DPB1, CLEC2B, IFI44, IFI44L, IFI27, IFIT1, IFIT2, SP110 ve IFNK) aşırı ekspresyonu ve Notch sinyal yolunda rol oynayan genlerin düşük regülasyonu ile deregülasyon olduğunu bulduk. MC1R varyant taşıyıcılarında 3570 transkript deregülasyona uğradı. Özellikle oksidatif stres ve DNA hasar yolları ile ilgili genler, Parkinson, Alzheimer ve Huntington gibi nörodejeneratif hastalıklarla ilişkili genlerin yanı sıra yukarı regüle edildi. Son olarak, CDKN2A mutasyonları veya MC1R varyantlarını taşıyan fenotipik olarak normal hücrelerde tespit edilen ifade imzalarının cilt kanseri tümörlerinde (melanom ve skuamöz hücreli karsinom) korunduğunu gözlemledik. Bu sonuçlar, transkriptom deregülasyonunun cilt kanseri gelişimi için kritik olan erken bir olayı temsil ettiğini göstermektedir.
Özgün kaynak özetini okuyun
Germline mutations in CDKN2A and/or red hair color variants in MC1R genes are associated with an increased susceptibility to develop cutaneous melanoma or non melanoma skin cancer. We studied the impact of the CDKN2A germinal mutation p.G101W and MC1R variants on gene expression and transcription profiles associated with skin cancer. To this end we set-up primary skin cell co-cultures from siblings of melanoma prone-families that were later analyzed using the expression array approach. As a result, we found that 1535 transcripts were deregulated in CDKN2A mutated cells, with over-expression of immunity-related genes (HLA-DPB1, CLEC2B, IFI44, IFI44L, IFI27, IFIT1, IFIT2, SP110 and IFNK) and down-regulation of genes playing a role in the Notch signaling pathway. 3570 transcripts were deregulated in MC1R variant carriers. In particular, genes related to oxidative stress and DNA damage pathways were up-regulated as well as genes associated with neurodegenerative diseases such as Parkinson's, Alzheimer and Huntington. Finally, we observed that the expression signatures indentified in phenotypically normal cells carrying CDKN2A mutations or MC1R variants are maintained in skin cancer tumors (melanoma and squamous cell carcinoma). These results indicate that transcriptome deregulation represents an early event critical for skin cancer development.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.