NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Leucine-zengin tekrar kinaz 2 (LRRK2), Parkinson hastalığı (PD) için potansiyel hastalık değiştirici terapötik stratejiler için değerli bir hedef olarak kabul edilen karmaşık, çok alanlı bir proteindir. Memeli hücrelerinde ve beyinde, LRRK2 fosforiledir ve LRRK2 kinaz aktivitesinin inhibitörleri olan hücrelerin tedavisi, Ser910/935/955/973 de dahil olmak üzere bir serin kümesinde LRRK2 defosforilasyonunu indükleyebilir. Bu bölgelerdeki fosforilasyon seviyelerinin LRRK2 kinaz aktivitesini yansıttığı öne sürülmüştür, ancak LRRK2 veya kinaz aktive edici varyantların kinaz-ölü varyantları, vahşi tipe kıyasla değiştirilmiş Ser935 fosforilasyon seviyelerini göstermez. Ayrıca, Ser910/935/955/973 otofosforilasyon siteleri değildir, bu nedenle inhibitör indüklenmiş defosforilasyonun bileşiklerin LRRK2 üzerindeki aktivitesine bağlı olup olmadığı veya henüz yukarı yöndeki kinazların tanımlanmasına bağlı olup olmadığı belirsizdir. Burada kinomun tüm dallarına karşı yönlendirilen 160 ATP rekabetçi ve hücre geçirgen kinaz inhibitörlerinden oluşan bir panel kullandık ve LRRK2 in vitro üzerindeki aktivitelerini peptid-substrat bazlı kinaz tahlili kullanarak test ettik. Nöronal SH-SY5Y hücrelerinde LRRK2'yi aşırı ifade ederken, okuma olarak Ser935'in bileşik kaynaklı defosforilasyonunu kullandık. Seçilen bileşiklerin silico kenetlenmesinde modellenmiş bir LRRK2 kinaz yapısı kullanılarak gerçekleştirildi. Alıcı işletim karakteristik arsaları, elde edilen kenetlenme puanlarının LRRK2 ATP bağlanma bölgesine in vitro ve hücresel bileşik aktivitesi ile ilişkili olduğunu göstermiştir. Ayrıca, in vitro vitro vitronun hücresel bileşik indüklenmiş LRRK2 defosforilasyon aktivitesi ile çoklu bileşik sınıfları arasında yüksek derecede korelasyon gösterdiğini bulduk. Bu nedenle, inhibitör tedavi edilen hücrelerde Ser935'teki akut LRRK2 defosforilasyon, yukarı kinazlar için bir rol dışlamadan, LRRK2'nin kendisinde inhibitör aktivitesinin güçlü bir bileşenini içerir. LRRK2 fosforilasyonunun kinaz inhibitörleri tarafından düzenlenmesini anlamak, LRRK2 sinyalizasyonunu anlamamıza yardımcı olur ve LRRK2 kinaz inhibitörlerinin yeni sınıflarının geliştirilmesine yol açabilir.
Özgün kaynak özetini okuyun
Leucine-rich repeat kinase 2 (LRRK2) is a complex, multidomain protein which is considered a valuable target for potential disease-modifying therapeutic strategies for Parkinson's disease (PD). In mammalian cells and brain, LRRK2 is phosphorylated and treatment of cells with inhibitors of LRRK2 kinase activity can induce LRRK2 dephosphorylation at a cluster of serines including Ser910/935/955/973. It has been suggested that phosphorylation levels at these sites reflect LRRK2 kinase activity, however kinase-dead variants of LRRK2 or kinase activating variants do not display altered Ser935 phosphorylation levels compared to wild type. Furthermore, Ser910/935/955/973 are not autophosphorylation sites, therefore, it is unclear if inhibitor induced dephosphorylation depends on the activity of compounds on LRRK2 or on yet to be identified upstream kinases. Here we used a panel of 160 ATP competitive and cell permeable kinase inhibitors directed against all branches of the kinome and tested their activity on LRRK2 in vitro using a peptide-substrate-based kinase assay. In neuronal SH-SY5Y cells overexpressing LRRK2 we used compound-induced dephosphorylation of Ser935 as readout. In silico docking of selected compounds was performed using a modeled LRRK2 kinase structure. Receiver operating characteristic plots demonstrated that the obtained docking scores to the LRRK2 ATP binding site correlated with in vitro and cellular compound activity. We also found that in vitro potency showed a high degree of correlation to cellular compound induced LRRK2 dephosphorylation activity across multiple compound classes. Therefore, acute LRRK2 dephosphorylation at Ser935 in inhibitor treated cells involves a strong component of inhibitor activity on LRRK2 itself, without excluding a role for upstream kinases. Understanding the regulation of LRRK2 phosphorylation by kinase inhibitors aids our understanding of LRRK2 signaling and may lead to development of new classes of LRRK2 kinase inhibitors.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.