SINEUPs are modular antisense long non-coding RNAs that increase synthesis of target proteins in cells.

Araştırma özeti

Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by

Yeni uzun kodlamayan RNA'ları (incRNA'lar) keşfetme ve işlevlerini geniş bir biyolojik süreç yelpazesinde ortaya koyma çabalarına rağmen, biyoteknolojik veya terapötik araçlar olarak uygulamaları henüz bebeklik dönemindedir. Son zamanlarda Parkinson hastalığı ile ilişkili gen Ubiquitin karboksil-terminal esteraz L1 (Uchl1)'e karşı doğal bir lncRNA antisens olan AS Uchl1'in, transkripsiyon sonrası seviyede UchL1 protein sentezini artırabildiğini gösterdik. Faaliyeti iki RNA elementi gerektirir: Çeviriyi artırmak için gömülü bir ters SINEB2 dizisi ve his mRNA'sını hedeflemek için üst üste binen bölge. Bu fonksiyonel organizasyon, protein kodlama genlerine karşı birkaç fare lncRNA'sı ile paylaşılır. AS Uchl1-türevli lncRNA'ların hedef mRNA çevirisinin arttırıcıları olarak potansiyel kullanımı keşfedilmemiştir. Burada AS Uchl1'i çeviriyi etkinleştiren yeni bir doğal ve sentetik antisens lncRNA'ların fonksiyonel sınıfının temsilcisi olarak tanımlıyoruz. Bu RNA'lar sınıfına, ters SINEB2 dizisinin gene özgü bir şekilde UP-düzenleme çevirisine olan gereksinimleri için SINEUP adını verdik. Üst üste binen bölge Bağlayan Doman (BD) olarak gösterilirken, gömülü ters SINEB2 öğesi Efektör Alanı (ED) olarak gösterilir. BD'yi değiştirerek, sentetik SINEUP'lar, ilgi çekici mRNA'ları hedeflemek için tasarlanmıştır. SINEUP'lar bir dizi hücre hattında işlev görür ve N-terminal olarak etiketlenmiş proteinlere verimli bir şekilde yönlendirilebilir. Biyolojik aktiviteleri, küçük RNA'ların uzunluğu aralığında minyatür bir versiyonda tutulur. Modüler yapısı, endojen Parkinson hastalığı ile ilişkili DJ-1'i hedefleyen sentetik SINEUP'ları başarıyla tasarlamak için kullanıldı ve farklı nöronal hücre hatlarında aktif olduğu kanıtlandı. Özetle, SINEUP'lar, ilgi çekici proteinlerin sentezini artıran ilk ölçeklenebilir aracı temsil eder. SINEUP'ları moleküler biyoloji deneyleri, protein üretiminde ve haploinsufficiencys terapisinde reaktifler olarak sunuyoruz.

Özgün kaynak özetini okuyun

Despite recent efforts in discovering novel long non-coding RNAs (lncRNAs) and unveiling their functions in a wide range of biological processes their applications as biotechnological or therapeutic tools are still at their infancy. We have recently shown that AS Uchl1, a natural lncRNA antisense to the Parkinson's disease-associated gene Ubiquitin carboxyl-terminal esterase L1 (Uchl1), is able to increase UchL1 protein synthesis at post-transcriptional level. Its activity requires two RNA elements: an embedded inverted SINEB2 sequence to increase translation and the overlapping region to target its sense mRNA. This functional organization is shared with several mouse lncRNAs antisense to protein coding genes. The potential use of AS Uchl1-derived lncRNAs as enhancers of target mRNA translation remains unexplored. Here we define AS Uchl1 as the representative member of a new functional class of natural and synthetic antisense lncRNAs that activate translation. We named this class of RNAs SINEUPs for their requirement of the inverted SINEB2 sequence to UP-regulate translation in a gene-specific manner. The overlapping region is indicated as the Binding Doman (BD) while the embedded inverted SINEB2 element is the Effector Domain (ED). By swapping BD, synthetic SINEUPs are designed targeting mRNAs of interest. SINEUPs function in an array of cell lines and can be efficiently directed toward N-terminally tagged proteins. Their biological activity is retained in a miniaturized version within the range of small RNAs length. Its modular structure was exploited to successfully design synthetic SINEUPs targeting endogenous Parkinson's disease-associated DJ-1 and proved to be active in different neuronal cell lines. In summary, SINEUPs represent the first scalable tool to increase synthesis of proteins of interest. We propose SINEUPs as reagents for molecular biology experiments, in protein manufacturing as well as in therapy of haploinsufficiencies.

Bilimsel değerlendirme

Araştırma sorusu

Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.

Yöntem ve örneklem

Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.

Temel bulgular

Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.

Sınırlılıklar

Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.

Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.