NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Parkinson hastalığının (PD) Mendelian formlarının genetik temelini anlamamızdaki birçok ilerlemeye rağmen, çok sayıda erken başlangıçlı vaka hala açıklanmaya devam etmektedir. Bu vakaların birçoğu, genetik nedenlerle altı çizilenle aynı olan, ancak şu anda bilinen hastalığa neden olan genlerin hiçbirinde mutasyona sahip olmayan bir hastalık türü ile birlikte bulunur. Burada, de novo mutasyonlarının bu erken başlangıçlı, sporadik vakaların bir oranını oluşturabileceğini varsaymıştık. Tam ebeveyn-çocuk üçlülerinde, probandın de novo mutasyonlarını kesin olarak tanımlamak için tipik PD ile sunduğu exome dizilimini gerçekleştirdik. Bu yaklaşım, genomdaki tüm genleri tarafsız bir şekilde test etmemizi sağlar. 21 trioda 20 kodlama de novo mutasyonu tespit ettik ve doğruladık. Varyant frekanslarını ve PD'deki bağımsız exome sıralama veri setimizi (1200'den fazla vaka ile) aynı genlerdeki ek varyantları tanımlamak için halka açık popülasyon genetik verilerini kullandık. De novo mutasyonları taşıdığı tespit edilen genlerden PTEN, VAPB ve ASNA1, PD'ye dahil edilecek çeşitli veri kaynakları tarafından desteklenmektedir. Bu genlerin PD genleri ile protein protein-protein etkileşim ağı içinde olduğunu ve bağımsız PD vaka kohortumuzda ek nadir, vakaya özgü mutasyonlar içerdiğini gösteriyoruz. Sonuçlarımız, bu üç genin PD'ye dahil edilmesini destekliyor ve sporadik hastalıktaki de novo mutasyonları için yapılan testlerin yeni hastalığa neden olan genlerin tanımlanmasına yardımcı olabileceğini öne sürüyor.
Özgün kaynak özetini okuyun
Despite the many advances in our understanding of the genetic basis of Mendelian forms of Parkinson's disease (PD), a large number of early-onset cases still remain to be explained. Many of these cases, present with a form of disease that is identical to that underlined by genetic causes, but do not have mutations in any of the currently known disease-causing genes. Here, we hypothesized that de novo mutations may account for a proportion of these early-onset, sporadic cases. We performed exome sequencing in full parent-child trios where the proband presents with typical PD to unequivocally identify de novo mutations. This approach allows us to test all genes in the genome in an unbiased manner. We have identified and confirmed 20 coding de novo mutations in 21 trios. We have used publicly available population genetic data to compare variant frequencies and our independent in-house dataset of exome sequencing in PD (with over 1200 cases) to identify additional variants in the same genes. Of the genes identified to carry de novo mutations, PTEN, VAPB and ASNA1 are supported by various sources of data to be involved in PD. We show that these genes are reported to be within a protein-protein interaction network with PD genes and that they contain additional rare, case-specific, mutations in our independent cohort of PD cases. Our results support the involvement of these three genes in PD and suggest that testing for de novo mutations in sporadic disease may aid in the identification of novel disease-causing genes.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.