NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Endotel hücreleri genellikle inflamasyon bölgelerinde bulunur. Bu durum, Alzheimer, Parkinson veya multipl skleroz gibi nörodejeneratif bozukluklardan etkilenen hastaların kan-beyin bariyerinin (BBB) endotel hücrelerinin yanı sıra bakteriyel menenjit, travma veya tümörle ilişkili iskemi durumlarında görülür. Enflamasyon, çoğunlukla NF-kappaB olmak üzere transkripsiyon faktörlerinin aktivasyonu yoluyla gen ekspresyonunun bilinen bir modülatörüdür. RLIP76 (a.k.a. Elektrofile-glutatyon konjugatlarının ATP'ye bağımlı bir taşıyıcısı olan RALBP1), sıkı bağlantı fonksiyonu, hücre yapışması ve ekzositozun düzenlenmesi yoluyla BBB geçirgenliğini modüle eder. RLIP76 tarafından düzenlenen genler ve yollar, tümör nekroz faktörü alfa (TNF-alfa) pro-inflamatuar molekülün transkripsiyonel hedefleridir ve RLIP76'nın da bir inflamasyon hedefi olabileceğini düşündürmektedir. TNF-alfa'nın RLIP76 üzerindeki etkilerini değerlendirmek için, TNF-alfa'ya karşı geçirimsiz referans genleri seçme sorunuyla karşılaştık. Bu tür genler insan BBB endotel hücrelerinde bilinmediğinden, bunları TNF-alfa'ya tabi tuttuk ve kantitatif RT-PCR tarafından referans genler olarak yaygın olarak kullanılan temizlik genlerinin ekspresyonu olarak ölçüldü. Çoğunun modüle edildiğini ve birkaç inflamasyon veri kümesinin analizinin yanı sıra, 300'den fazla hücre türünü ve hastalığı kapsayan 5000'den fazla insan dokusu örneğinin metaanalizi, tek bir temizlik geninin referans gen olarak kullanılamayacağını göstermektedir. Bununla birlikte, üç farklı algoritma kullanarak, TNF-alfa'ya karşı geçirimsiz bir referans genset ortaya çıkardık ve RLIP76 ifadesinin TNF-alfa tarafından indüklendiğini ve iltihaplanma işaretlerinin indüksiyon kinetiğini takip ettiğini ilk kez gösterdik, bu da inflamasyonun BBB'deki RLIP76 ifadesini etkileyebileceğini düşündürdü. Ayrıca MRP1'in (a.k.a. Başka bir elektrofil-glutatyon taşıyıcısı olan ABCC1), aynı hücrelerde ve koşullarda modüle edilmez, bu da TNF-alfa tarafından RLIP76 düzenlemesinin glutatyon taşıyıcılarının genel bir özelliği olmadığını gösterir. Burada ortaya çıkarılan referans genleri, BBB'nin enflamatuar koşullarında gelecekteki gen ekspresyonu çalışmalarına yardımcı olmalıdır.
Özgün kaynak özetini okuyun
Endothelial cells are often present at inflammation sites. This is the case of endothelial cells of the blood-brain barrier (BBB) of patients afflicted with neurodegenerative disorders such as Alzheimer's, Parkinson's, or multiple sclerosis, as well as in cases of bacterial meningitis, trauma, or tumor-associated ischemia. Inflammation is a known modulator of gene expression through the activation of transcription factors, mostly NF-κB. RLIP76 (a.k.a. RALBP1), an ATP-dependent transporter of electrophile-glutathione conjugates, modulates BBB permeability through the regulation of tight junction function, cell adhesion, and exocytosis. Genes and pathways regulated by RLIP76 are transcriptional targets of tumor necrosis factor alpha (TNF-α) pro-inflammatory molecule, suggesting that RLIP76 may also be an inflammation target. To assess the effects of TNF-α on RLIP76, we faced the problem of choosing reference genes impervious to TNF-α. Since such genes were not known in human BBB endothelial cells, we subjected these to TNF-α, and measured by quantitative RT-PCR the expression of housekeeping genes commonly used as reference genes. We find most to be modulated, and analysis of several inflammation datasets as well as a metaanalysis of more than 5000 human tissue samples encompassing more than 300 cell types and diseases show that no single housekeeping gene may be used as a reference gene. Using three different algorithms, however, we uncovered a reference geneset impervious to TNF-α, and show for the first time that RLIP76 expression is induced by TNF-α and follows the induction kinetics of inflammation markers, suggesting that inflammation can influence RLIP76 expression at the BBB. We also show that MRP1 (a.k.a. ABCC1), another electrophile-glutathione transporter, is not modulated in the same cells and conditions, indicating that RLIP76 regulation by TNF-α is not a general property of glutathione transporters. The reference geneset uncovered herein should aid in future gene expression studies in inflammatory conditions of the BBB.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.