The Effect of Statins on Blood Gene Expression in COPD.

Araştırma özeti

Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by

BackgroundCOPD şu anda dünya çapında dördüncü önde gelen ölüm nedenidir. Statinler, belgelenmiş kardiyovasküler faydaları olan lipid düşürücü ajanlardır. Gözlemsel çalışmalar, statinlerin KOAH'ta yararlı bir role sahip olabileceğini göstermiştir. Statinlerin KOAH hastalarından kan geni ekspresyonu üzerindeki etkisi büyük ölçüde bilinmemektedir.KOAH hastalarında statin kullanımı ile ilişkili kan geni imzasını ObjectiveIdentify kan geni imzası ve KOAH'ta herhangi bir potansiyel faydayı açıklayabilecek bu imzanın altını çizen yollar.MethodsWhole kan geni ekspresyonu 168 statin kullanıcısı ve Afymetrix Humanarrix Gene ST 1.1 mikro çipleri kullanılarak ECLIPSE çalışmasından kullanıcısı olmayan 451 üzerinde ölçülmüştür. İfade verilerini işlemek için Sağlam Mikroarray Özetleme Faktör Analizi (FARMS) kullanıldı. Diferansiyel gen ekspresyon analizi, Propensity skoru ve taşıyıcı değişkenler için Linear Models for Microarray data (Limma) paket ayarlaması kullanılarak gerçekleştirildi. Yayınlanan gen ekspresyon profilleriyle ifade sinyalinin benzerliği ProfilChaser.Results25 genlerinde, statin kullanıcıları ve olmayanlar arasında LDLR, CXCR2, SC4MOL, FAM108A1, IFI35, FRIL, ABCG1, MYLIP ve DHCR24 dahil %10'luk bir FDR'de diferansiyel olarak ifade edilmiştir. 25 gen, kolesterol homeostazı ve metabolizma yollarında önemli ölçüde zenginleştirildi. Elde edilen gen imzası Huntington hastalığı, Parkinson hastalığı ve akut miyeloid lösemi gen imzaları ile korelasyon gösterdi.KonvansiyonKoAH hastalarında statinlerin kullanımının kan geni imzası kolesterol homeostaz yollarında zenginleştirildi. Bu yolların akciğer biyolojisindeki rolünü tanımlamak için daha ileri çalışmalara ihtiyaç vardır.

Özgün kaynak özetini okuyun

BackgroundCOPD is currently the fourth leading cause of death worldwide. Statins are lipid lowering agents with documented cardiovascular benefits. Observational studies have shown that statins may have a beneficial role in COPD. The impact of statins on blood gene expression from COPD patients is largely unknown.ObjectiveIdentify blood gene signature associated with statin use in COPD patients, and the pathways underpinning this signature that could explain any potential benefits in COPD.MethodsWhole blood gene expression was measured on 168 statin users and 451 non-users from the ECLIPSE study using the Affymetrix Human Gene 1.1 ST microarray chips. Factor Analysis for Robust Microarray Summarization (FARMS) was used to process the expression data. Differential gene expression analysis was undertaken using the Linear Models for Microarray data (Limma) package adjusting for propensity score and surrogate variables. Similarity of the expression signal with published gene expression profiles was performed in ProfileChaser.Results25 genes were differentially expressed between statin users and non-users at an FDR of 10%, including LDLR, CXCR2, SC4MOL, FAM108A1, IFI35, FRYL, ABCG1, MYLIP, and DHCR24. The 25 genes were significantly enriched in cholesterol homeostasis and metabolism pathways. The resulting gene signature showed correlation with Huntington's disease, Parkinson's disease and acute myeloid leukemia gene signatures.ConclusionThe blood gene signature of statins' use in COPD patients was enriched in cholesterol homeostasis pathways. Further studies are needed to delineate the role of these pathways in lung biology.

Bilimsel değerlendirme

Araştırma sorusu

Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.

Yöntem ve örneklem

Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.

Temel bulgular

Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.

Sınırlılıklar

Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.

Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.