NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Arka planParkinson hastalığı (PD), motor semptomlar açısından klinik olarak tanımlanan kronik bir progresif nörodejeneratif bozukluktur. Bunlar, hastalığın sistemik doğasını kanıtlayan prodromal motor olmayan belirtilerden önce gelir. Canlı hastalarda değişen genlerin ve yolların belirlenmesi, sporadik PD'nin tanı ve patogenezi hakkında yeni bilgiler sağlar. 40 sporadik PD hastasının kanında gen ekspresyonunda MetodlarDeğişiklikler ve 20 sağlıklı kontroller ("Discovery set") Afymetrix platformundan faydalanılarak analiz edilmiştir. Hastalar motor semptomların başlangıcında ve herhangi bir farmakolojik tedaviye başlamadan önce idi. Veri analizi, Mikroarrayların Ranking-Principal Bileşen Analizi, PUMA ve Anlam Analizi uygulanarak gerçekleştirildi. Fonksiyonel açıklamalar, diferansiyel olarak ifade edilen genlerdeki önemli zenginleştirilmiş biyolojik süreçleri ortaya çıkarmak için GO, DAVID, GSEA kullanılarak atandı. Seçilen genlerin ifadeleri RT-qPCR ve 12 hasta ve kontrolden oluşan bağımsız bir kohorttan alınan örnekler ("Validation set") kullanılarak doğrulandı.ResultsGene kan örneklerinin ekspresyon profillemesi, PD hastalarını sağlıklı kontrollerden ayırır ve kandaki farklı olarak ifade edilen genleri tanımlar. Bunların çoğu, nörodejenerasyonun önemli bölgesi olan Substantia Nigra'nın dopaminerjik nöronlarında da bulunur. PD kanının ve ölüm sonrası beyinlerin önceki analizinde bulunan nöronal apoptoz, lenfosit aktivasyonu ve mitokondriyal disfonksiyon ile birlikte, kromatin remodeling ve metilasyon da dahil olmak üzere epigenetik modifikasyonlarla ilgili biyolojik terimlerle zenginleştirilmiş transkriptom değişikliklerini açıkladık. CBX5, TCF3, MAN1C1 ve DOCK10 olarak aday transkriptler RT-qPCR.Conclusions tarafından doğrulanmıştır.Verilerimiz, nörodejeneratif hastalıkları incelemek için kan transkriptlerinin kullanımını desteklemektedir. Kromatin remodeling ve metilasyon makinelerinin önemli bileşenlerindeki değişiklikleri, terapötik müdahalenin hedefi olarak epigenetik öneren sporadik PD'deki erken olaylar olarak tanımlar.
Özgün kaynak özetini okuyun
BackgroundParkinson's disease (PD) is a chronic progressive neurodegenerative disorder that is clinically defined in terms of motor symptoms. These are preceded by prodromal non-motor manifestations that prove the systemic nature of the disease. Identifying genes and pathways altered in living patients provide new information on the diagnosis and pathogenesis of sporadic PD.MethodsChanges in gene expression in the blood of 40 sporadic PD patients and 20 healthy controls ("Discovery set") were analyzed by taking advantage of the Affymetrix platform. Patients were at the onset of motor symptoms and before initiating any pharmacological treatment. Data analysis was performed by applying Ranking-Principal Component Analysis, PUMA and Significance Analysis of Microarrays. Functional annotations were assigned using GO, DAVID, GSEA to unveil significant enriched biological processes in the differentially expressed genes. The expressions of selected genes were validated using RT-qPCR and samples from an independent cohort of 12 patients and controls ("Validation set").ResultsGene expression profiling of blood samples discriminates PD patients from healthy controls and identifies differentially expressed genes in blood. The majority of these are also present in dopaminergic neurons of the Substantia Nigra, the key site of neurodegeneration. Together with neuronal apoptosis, lymphocyte activation and mitochondrial dysfunction, already found in previous analysis of PD blood and post-mortem brains, we unveiled transcriptome changes enriched in biological terms related to epigenetic modifications including chromatin remodeling and methylation. Candidate transcripts as CBX5, TCF3, MAN1C1 and DOCK10 were validated by RT-qPCR.ConclusionsOur data support the use of blood transcriptomics to study neurodegenerative diseases. It identifies changes in crucial components of chromatin remodeling and methylation machineries as early events in sporadic PD suggesting epigenetics as target for therapeutic intervention.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.