NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Genetik Creutzfeldt-Jakob hastalığı (gCJD) dahil olmak üzere kalıtsal prion hastalıkları (IPD'ler), prion hastalıkları vakalarının% 10-15'ini oluşturur ve prion protein geninde (PRNP) P102L, V180I ve E200K dahil olmak üzere çeşitli patojenik mutasyonlarla ilişkilidir. PRNP'nin kodon 180'de (V180I) izoleucine ikame edilen valine, Doğu Asya hastalarında gCJD'ye neden olan en yaygın patojenik mutasyondur. Bu çalışmada, aday faktörleri ve bunların hastalık başlangıcı ile olan ilişkilerini belirlemek için takip analizleri yaptık. V180I mutasyonu olan beş gCJD hastasının ve genomik farklılıkları tanımlamak için 145 sağlıklı bireyin tüm genom dizilimi (WGS) verileri kullanılmıştır. Sadece hasta grubunda toplam 18.648.850 aday varyantı gözlendi, bunların 29'u varyant olarak doğrulandı. Bu doğrulanmış varyantların dördü anlamsız mutasyonlardı, altısı doğrudan veya dolaylı olarak LPA, LRRK2 ve FGF20 gibi nörodejeneratif bozukluklarla (ND'ler) ilişkili genlerde gözlendi. Doğrulanmış varyantların yarısından fazlası, gen ontolojisi (GO) bağlayıcı ve/veya katalitik aktivite terimlerinde kategorize edilmiştir. Dahası, V180I mutasyonu olan gCJD hastalarında diferansiyel genom varyantları bulduk, bunlardan biri hastalığın teşhisinden 10 yıl sonra benzersiz bir şekilde hayatta kaldı. GCJD ile Alzheimer hastalığı veya Parkinson hastalığı arasındaki ilişkilerin genomik düzeyde aydınlatılması, ND'lerin patogenezine aracılık eden spesifik mekanizmaları ve ND'ler için altın standart terapileri anlamamızda daha fazla ilerlemeyi kolaylaştıracaktır.
Özgün kaynak özetini okuyun
Inherited prion diseases (IPDs), including genetic Creutzfeldt-Jakob disease (gCJD), account for 10-15% of cases of prion diseases and are associated with several pathogenic mutations, including P102L, V180I, and E200K, in the prion protein gene (PRNP). The valine to isoleucine substitution at codon 180 (V180I) of PRNP is the most common pathogenic mutation causing gCJD in East Asian patients. In this study, we conducted follow-up analyses to identify candidate factors and their associations with disease onset. Whole-genome sequencing (WGS) data of five gCJD patients with V180I mutation and 145 healthy individuals were used to identify genomic differences. A total of 18,648,850 candidate variants were observed in only the patient group, 29 of them were validated as variants. Four of these validated variants were nonsense mutations, six were observed in genes directly or indirectly related to neurodegenerative disorders (NDs), such as LPA, LRRK2, and FGF20. More than half of validated variants were categorized in Gene Ontology (GO) terms of binding and/or catalytic activity. Moreover, we found differential genome variants in gCJD patients with V180I mutation, including one uniquely surviving 10 years after diagnosis of the disease. Elucidation of the relationships between gCJD and Alzheimer's disease or Parkinson's disease at the genomic level will facilitate further advances in our understanding of the specific mechanisms mediating the pathogenesis of NDs and gold standard therapies for NDs.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.