NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Parkinson hastalığı (PD), 65 yaşın üzerindeki nüfusun %1'ini etkileyen en yaygın nörodejeneratif hareket bozukluğudur ve substantia nigra pars compakta dopamin nöronlarının tercihli kaybının eşlik ettiği hem motor hem de motor olmayan semptomlarla klinik olarak karakterize edilir. Burada, Oxford Parkinson Hastalık Merkezi Discovery Cohort'tan seçilen 244 Parkinson hastasının exome'lerini sıraladık ve kalite kontrolünden sonra analizler için 228 exomes mevcuttu. PD hasta exomeleri UK10K veri kümelerinden seçilen 884 kontrol exomesi ile karşılaştırıldı. Tek bir senonym olmayan (NS) tek nükleotid varyantı (SNV) veya daha yüksek bir NS SNV yükü taşıyan herhangi bir gen, çoklu test düzeltmesinden sonra PD durumuyla önemli ölçüde ilişkili değildi. Bununla birlikte, proteinleri hücre dışı matriste rol oynayan genlerin önemli ölçüde zenginleştirilmesi, en önemli şekilde ilişkili NS SNV'lere sahip ilk 300 gen arasında yer alırken, yakın zamanda yapılan bir Genom Geniş Birliği (GWA) çalışması ile PD ile ilişkili bölgeler, PD ile ilişkili NS SNV'leri içeren genlerde zenginleştirildi. Nadir PD ile ilişkili SNV'lere sahip GWA bölgelerindeki genleri inceleyerek, RAD51B'yi tanımladık. RAD51B'nin protein ürünü, doğuştan ayna hareketleri fenotipleri ile ilişkili olan paralog RAD51 ile etkileşime girer, bir fenotip de PD ile komorbiddir.
Özgün kaynak özetini okuyun
Parkinson's disease (PD) is the most common neurodegenerative movement disorder, affecting 1% of the population over 65 years characterized clinically by both motor and non-motor symptoms accompanied by the preferential loss of dopamine neurons in the substantia nigra pars compacta. Here, we sequenced the exomes of 244 Parkinson's patients selected from the Oxford Parkinson's Disease Centre Discovery Cohort and, after quality control, 228 exomes were available for analyses. The PD patient exomes were compared to 884 control exomes selected from the UK10K datasets. No single non-synonymous (NS) single nucleotide variant (SNV) nor any gene carrying a higher burden of NS SNVs was significantly associated with PD status after multiple-testing correction. However, significant enrichments of genes whose proteins have roles in the extracellular matrix were amongst the top 300 genes with the most significantly associated NS SNVs, while regions associated with PD by a recent Genome Wide Association (GWA) study were enriched in genes containing PD-associated NS SNVs. By examining genes within GWA regions possessing rare PD-associated SNVs, we identified RAD51B. The protein-product of RAD51B interacts with that of its paralogue RAD51, which is associated with congenital mirror movements phenotypes, a phenotype also comorbid with PD.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.