SCIENTIFIC HUB

Araştırmanın izini sürün.

SCIENTIFIC LITERATURE · MED

Parkinson ve Alzheimer hastalığı için daha hızlı literatür kürünü desteklemek için otomatik PDF vurgulama.

Automated PDF highlighting to support faster curation of literature for Parkinson's and Alzheimer's disease.

Makine çevirisi · Editoryal inceleme bekliyor

Database (Oxford) · 2017-01-01

DOI: 10.1093/database/bax027PMID: 28365743

Open accessResearch Support, Non-U.S. Gov't; research-article; Journal ArticleKaynağa git ↗

Araştırma özeti

Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by

Parkinson ve Alzheimer hastalığı gibi nörodejeneratif bozukluklar yıkıcı ve maliyetli hastalıklardır ve büyük küresel yük kaynağıdır. Hastalara başarılı müdahaleler sağlamak ve maliyetleri azaltmak için hem nedenlerin hem de patolojik süreçlerin anlaşılması gerekir. ApiNATOMY projesi, bu hastalıklar üzerine toplanan geniş edebiyat gövdesinden elde edilen verileri elle düzenleyerek ve soyutlayarak nörodejeneratif bozukluklar anlayışımıza katkıda bulunmayı amaçlamaktadır. Küratörlük emek yoğun olduğu için, küratör için öncelikli öneme sahip PDF belgesinin bu bölümlerini otomatik olarak vurgulayarak süreci hızlandırmayı amaçladık. Özetleme tekniklerine benzer teknikler kullanarak, dilsel, semantik ve mekansal özelliklere dayanan bir algoritma geliştirdik. Bu algoritmayı alet hassasiyeti için manuel olarak düzeltilmiş bir test setinde kullanarak, en iyi kelime çantası temel modeline kıyasla% 132 artış gösteren 0.51'lik bir makro F 1 - önlemi elde ettik. 40 görünmeyen yayın üzerindeki metodolojinin kullanışlılığını değerlendirmek için kullanıcı tabanlı bir değerlendirme de yapıldı; bu da, vurgulanan tüm cümlelerin %85'inin kürasyon göreviyle ilgili olduğunu ve vakaların yaklaşık %65'inde vurguların, tam metine danışmaya gerek kalmadan bilgi kürasyon görevini desteklemek için yeterli olduğunu ortaya koyuyor. Sonuç olarak, bunların kürasyonla ilgili cümlelerin tanınmasını otomatikleştirmede bir adım için umut verici sonuçlar olduğuna inanıyoruz. Kazı öncesi kağıtlara yaklaşımımızı rafine etmek, kürasyon sürecinde daha hızlı işleme ve maliyet azalmasına yol açacaktır.Database urlhttps://github.com/KHP-Informatics/NapEasy.

Özgün kaynak özetini okuyun

Neurodegenerative disorders such as Parkinson's and Alzheimer's disease are devastating and costly illnesses, a source of major global burden. In order to provide successful interventions for patients and reduce costs, both causes and pathological processes need to be understood. The ApiNATOMY project aims to contribute to our understanding of neurodegenerative disorders by manually curating and abstracting data from the vast body of literature amassed on these illnesses. As curation is labour-intensive, we aimed to speed up the process by automatically highlighting those parts of the PDF document of primary importance to the curator. Using techniques similar to those of summarisation, we developed an algorithm that relies on linguistic, semantic and spatial features. Employing this algorithm on a test set manually corrected for tool imprecision, we achieved a macro F 1 -measure of 0.51, which is an increase of 132% compared to the best bag-of-words baseline model. A user based evaluation was also conducted to assess the usefulness of the methodology on 40 unseen publications, which reveals that in 85% of cases all highlighted sentences are relevant to the curation task and in about 65% of the cases, the highlights are sufficient to support the knowledge curation task without needing to consult the full text. In conclusion, we believe that these are promising results for a step in automating the recognition of curation-relevant sentences. Refining our approach to pre-digest papers will lead to faster processing and cost reduction in the curation process.Database urlhttps://github.com/KHP-Informatics/NapEasy.

Bilimsel değerlendirme

01

Araştırma sorusu

Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.

02

Yöntem ve örneklem

Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.

03

Temel bulgular

Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.

04

Sınırlılıklar

Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.

Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.