NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
AmaçlarErken başlangıçlı Parkinson hastalığının (PD) tekrarlayan 22q11.2 silme ile ilişkili hastalık risk mekanizmalarını araştırmak için, erken başlangıçlı PD için genetik bir risk faktörü.MetodlarBir primer çalışma kanıtında, 22q11.2DS ile dokuz yetişkinde dizi varyantlarını araştırmak için tüm genom dizilimini (WGS) kullandık, üçü nöropatolojik olarak erken başlangıçlı PD ve altısı PD olmadan doğrulandı. Yakın zamanda 22q11.2DS'de şizofreniyi incelemek için kullanılan bir yaklaşım benimseyerek, burada PD ile ilgili aday gen kümelerini test ettik.Sonuçlar PD'li vakalarda yaygın olan mutasyonlar bozulmamış 22q11.2 bölgesinde bulunmadı. Hepsi PD hastalığı neden olan ve risk genlerini içeren bir gen kümesindeki nadir mutasyonlar için negatifken, PD ile işlevsel olarak ilgili 1000 genden oluşan bir başka aday gen kümesi, PD vakalarında nadir görülen varsayılan olarak zarar verici duyu varyantlarının nominal olarak anlamlı (P = 0.03) bir zenginleştirmesini sundu. PD riski ile ilişkili ortak varyantlara dayanan polijenik skor sonuçları, PD'lilerde önemli ölçüde daha büyüktü.SonuçlarPD'deki WGS'nin bu ilk pilot çalışmasının sonuçları, genom çapında dizi varyantlarının kümülatif yükünün, 22q11.2 silmenin eşik düşürücü dozaj etkileri varlığında erken başlangıçlı PD'nin ekspresyonuna katkıda bulunabileceğini düşündürmektedir. 22q11.2DS'deki PD ifadesinin, 22q11.2 kromozomundaki bozulmamış bir resesif lokus veya bilinen PD genlerindeki mutasyonlar tarafından aracılık ettiğine dair hiçbir kanıt bulamadık. Bu bulgular, PD'nin ekspresyonu ve PD'nin etiyolojisinin incelenmesi için yeni nesil dizilemenin yararı üzerindeki çoklu birey içi nadir varyantların potansiyel etkilerinin ilk kanıtlarını sunmaktadır.
Özgün kaynak özetini okuyun
ObjectivesTo investigate disease risk mechanisms of early-onset Parkinson's disease (PD) associated with the recurrent 22q11.2 deletion, a genetic risk factor for early-onset PD.MethodsIn a proof-of-principle study, we used whole-genome sequencing (WGS) to investigate sequence variants in nine adults with 22q11.2DS, three with neuropathologically confirmed early-onset PD and six without PD. Adopting an approach used recently to study schizophrenia in 22q11.2DS, here we tested candidate gene-sets relevant to PD.ResultsNo mutations common to the cases with PD were found in the intact 22q11.2 region. While all were negative for rare mutations in a gene-set comprising PD disease-causing and risk genes, another candidate gene-set of 1000 genes functionally relevant to PD presented a nominally significant (P = 0.03) enrichment of rare putatively damaging missense variants in the PD cases. Polygenic score results, based on common variants associated with PD risk, were non-significantly greater in those with PD.ConclusionsThe results of this first-ever pilot study of WGS in PD suggest that the cumulative burden of genome-wide sequence variants may contribute to expression of early-onset PD in the presence of threshold-lowering dosage effects of a 22q11.2 deletion. We found no evidence that expression of PD in 22q11.2DS is mediated by a recessive locus on the intact 22q11.2 chromosome or mutations in known PD genes. These findings offer initial evidence of the potential effects of multiple within-individual rare variants on the expression of PD and the utility of next generation sequencing for studying the etiology of PD.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.