NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Parkinson hastalığının monojenik formunun şimdiye kadar bilinen en yaygın nedeni, lösin bakımından zengin tekrar kinaz 2 (LRRK2) geninin G2019S mutasyonudur. Sıklığı, Asya'da %0,1'den az olan etnik gruplar ve coğrafi bölgeler arasında büyük ölçüde değişir ve Kuzey Afrika'da % 40'a kadar değişir. Bu mutasyonun üç farklı haplotipi vardır; haplotip 1 en eski ve en yaygın olanıdır. Son çalışmalar, G2019S mutasyonunun haplotip 1'ini yaklaşık 4000 yıl öncesine tarihlendirmiştir, ancak mutasyonun Yakın Doğu veya Fas-Berber atasal kökeni olup olmadığı tartışmalıdır. Bu evrimsel tarihi deşifre etmek için, Berberi veya Arap kökeninin konuşulan dile dayalı 3 nesil boyunca kurulduğu G2019S mutasyonunu taşıyan toplam 57 ilgisiz Fas PD hastasında 11.27 Mb'lik bir bölgeyi kapsayan 10 mikrosalit işaretçiyi genotipledik. 36 Arap konuşan ve 15 Berberi konuşan G2019S taşıyıcısı için en son ortak atanın yaşını 10-4 mutasyon oranıyla olasılık temelli yöntemi kullanarak tahmin ettik. Veri analizi, en kısa haplotipin Berberi etnik kökenine sahip bir hastadan kaynaklandığını göstermektedir. Ortak kurucunun Arap hastalar için 159 nesil önce (%95 CI 116-224), Berberi hastalar için ise 200 nesil önce (%95 CI 123-348) yaşadığı tahmin edilmektedir. Daha sonra, mutasyonu taşıyan 29 yerli Kuzey Afrika erkeği, sırasıyla baba ve anne katkılarını incelemek için Y-kromozomunu (E-M81, E-M78 ve M-267) ve mitokondriyal DNA'yı (mtDNA) hiperdeğişken bölgeleri (HV1 ve HV2) sıralayarak spesifik tek ebeveynli belirteçler için değerlendirildi. Sonuçlar, otokton genetik bileşenin mtDNA (Eurasian ve Kuzey Afrika haplogrupları) için %76, Y-kromozomu (E-M81 ve E-M78) için %59'a ulaştığını gösterdi ve bu da G2019S mutasyonunun otokton DNA havuzunda ortaya çıkmış olabileceğini düşündürdü. Bu nedenle, LRRK2 G2019S mutasyonunun büyük olasılıkla en az 5000 yıl önce yaşamış bir Berberi kurucusundan kaynaklandığı sonucuna vardık (95% CI 3075-8700).
Özgün kaynak özetini okuyun
The most common cause of the monogenic form of Parkinson's disease known so far is the G2019S mutation of the leucine-rich repeat kinase 2 (LRRK2) gene. Its frequency varies greatly among ethnic groups and geographic regions ranging from less than 0.1% in Asia to 40% in North Africa. This mutation has three distinct haplotypes; haplotype 1 being the oldest and most common. Recent studies have dated haplotype 1 of the G2019S mutation to about 4000 years ago, but it remains controversial whether the mutation has a Near-Eastern or Moroccan-Berber ancestral origin. To decipher this evolutionary history, we genotyped 10 microsatellite markers spanning a region of 11.27 Mb in a total of 57 unrelated Moroccan PD patients carrying the G2019S mutation for which the Berber or Arab origin was established over 3 generations based on spoken language. We estimated the age of the most recent common ancestor for the 36 Arab-speaking and the 15 Berber-speaking G2019S carriers using the likelihood-based method with a mutation rate of 10-4. Data analysis suggests that the shortest haplotype originated in a patient of Berber ethnicity. The common founder was estimated to have lived 159 generations ago (95% CI 116-224) for Arab patients, and 200 generations ago (95% CI 123-348) for Berber patients. Then, 29 native North African males carrying the mutation were assessed for specific uniparental markers by sequencing the Y-chromosome (E-M81, E-M78, and M-267) and mitochondrial DNA (mtDNA) hypervariable regions (HV1 and HV2) to examine paternal and maternal contributions, respectively. Results showed that the autochthonous genetic component reached 76% for mtDNA (Eurasian and north African haplogroups) and 59% for the Y-chromosome (E-M81 and E-M78), suggesting that the G2019S mutation may have arisen in an autochthonous DNA pool. Therefore, we conclude that LRRK2 G2019S mutation most likely originated in a Berber founder who lived at least 5000 years ago (95% CI 3075-8700).
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.