SCIENTIFIC HUB

Araştırmanın izini sürün.

SCIENTIFIC LITERATURE · MED

BRAPH: Beyin bağlantısının analizi için bir grafik teorisi yazılımı.

BRAPH: A graph theory software for the analysis of brain connectivity.

Makine çevirisi · Editoryal inceleme bekliyor

PLoS One · 2017-08-01

DOI: 10.1371/journal.pone.0178798PMID: 28763447

Open accessresearch-article; Journal ArticleKaynağa git ↗

Araştırma özeti

Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by

Beyin, çalışmaları çeşitli bölgeleri arasındaki etkileşime dayanan büyük ölçekli karmaşık bir ağdır. Geçtiğimiz birkaç yılda, insan beyin ağının organizasyonu, beynin kenarlarla bağlı bir dizi düğüm olarak temsil edildiği grafik teorisinden kavramlar kullanılarak kapsamlı bir şekilde incelenmiştir. Beynin bir konektom olarak bu temsili, topolojik mimarisini yansıtan önemli önlemleri değerlendirmek için kullanılabilir. Yapısal manyetik rezonans görüntüleme (MRI), fonksiyonel MRI (fMRI), pozitron emisyon tomografisi (PET) ve elektroensefalogram (EEG) verilerinden türetilen beyin ağlarının bağlantı analizi için ücretsiz bir MatLab tabanlı yazılım (BRAPH-BRain Analizi) geliştirdik. BRAPH, bağlantı matrislerinin oluşturulmasına, küresel ve yerel ağ önlemlerinin hesaplanmasına, grup karşılaştırmaları için parametrik olmayan permütasyonların yapılmasına, ağdaki modüllerin değerlendirilmesine ve sonuçların rastgele ağlarla karşılaştırılmasına izin verir. Diğer araç kutularının aksine, aynı hastaların zaman içinde farklı noktalarda boylamsal karşılaştırmaları yapılmasına izin verir. Ayrıca, kullanıcı dostu bir arayüz sağlansa da, programın mimarisi modülerdir (nesne yönelimli) böylece kolayca genişletilebilir ve özelleştirilebilir. BRAPH'ın yeteneklerini göstermek için iki ayrı çalışmada yapısal ve fonksiyonel grafik teorisi analizleri yaptık. İlk çalışmada, MRI verilerini kullanarak, sağlıklı kontrollerde küresel ve nodal ağ topolojisi, amnestik hafif bilişsel bozukluğu olan hastalar ve Alzheimer hastalığı olan hastalardaki farklılıkları değerlendirdik. İkinci çalışmada, dinlenme durumu fMRI verilerini kullanarak, sağlıklı kontrolleri ve Parkinson hastalarını hafif bilişsel bozuklukla karşılaştırdık.

Özgün kaynak özetini okuyun

The brain is a large-scale complex network whose workings rely on the interaction between its various regions. In the past few years, the organization of the human brain network has been studied extensively using concepts from graph theory, where the brain is represented as a set of nodes connected by edges. This representation of the brain as a connectome can be used to assess important measures that reflect its topological architecture. We have developed a freeware MatLab-based software (BRAPH-BRain Analysis using graPH theory) for connectivity analysis of brain networks derived from structural magnetic resonance imaging (MRI), functional MRI (fMRI), positron emission tomography (PET) and electroencephalogram (EEG) data. BRAPH allows building connectivity matrices, calculating global and local network measures, performing non-parametric permutations for group comparisons, assessing the modules in the network, and comparing the results to random networks. By contrast to other toolboxes, it allows performing longitudinal comparisons of the same patients across different points in time. Furthermore, even though a user-friendly interface is provided, the architecture of the program is modular (object-oriented) so that it can be easily expanded and customized. To demonstrate the abilities of BRAPH, we performed structural and functional graph theory analyses in two separate studies. In the first study, using MRI data, we assessed the differences in global and nodal network topology in healthy controls, patients with amnestic mild cognitive impairment, and patients with Alzheimer's disease. In the second study, using resting-state fMRI data, we compared healthy controls and Parkinson's patients with mild cognitive impairment.

Bilimsel değerlendirme

01

Araştırma sorusu

Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.

02

Yöntem ve örneklem

Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.

03

Temel bulgular

Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.

04

Sınırlılıklar

Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.

Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.