Microarray Analysis of the Molecular Mechanism Involved in Parkinson's Disease.

Araştırma özeti

Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by

AmaçBu çalışma Parkinson hastalığının (PD) altında yatan moleküler mekanizmalarını biyoinformatik ile araştırmayı amaçladı.Mikroarray veri seti GSE72267'yi, PD hastalarından 40 kan örneği ve 19 eşleştirilmiş kontrol içeren Gene Expression Omnibus veritabanından kullanan, diferansiyel olarak ifade edilen genler (DEG'ler) veri ön işlemesinden sonra, ardından Gene Ontoloji (GO) ve Kyoto Encyclopedia of Genes and GenKome pathway. Protein-protein etkileşimi (PPI) ağı, mikroRNA- (miRNA-) hedef düzenleyici ağ ve transkripsiyon faktörü- (TF-) hedef düzenleyici ağlar oluşturuldu.SonuçlarToplanan 819 DEG'den 359'u yukarı, 460'ı aşağı doğru düzenlendi. İki GO terimi, "rRNA işleme" ve "sitoplazma" ve iki KEGG yolu, "metabolik yollar" ve "TNF sinyal yolu", PD gelişiminde rol oynadı. Hücreler arası yapışma molekülü 1 (ICAM1) PPI ağındaki hub düğümüydü; hsa-miR-7-5p, hsa-miR-433-3p ve hsa-miR-133b PD patogenezine katıldı. Çinko parmak ve BTB alan içeren 7A, ovo benzeri transkripsiyonel baskılayıcı 1, GATA bağlayıcı protein 3, transkripsiyon faktörü dp-1, SMAD aile üyesi 1 ve quiescin sülfihydril oksidaz 1 dahil olmak üzere altı TF, PD.Conclusions "rRNA işleme", "sitoplazma", "metabolik yollar" ve "TNF sinyalleme yolu" PD ile ilgili anahtar yollardı. ICAM1, hsa-miR-7-5p, hsa-miR-433-3p, hsa-miR-133b ve yukarıda belirtilen altı TF, PD gelişiminde önemli rol oynayabilir.

Özgün kaynak özetini okuyun

PurposeThis study aimed to investigate the underlying molecular mechanisms of Parkinson's disease (PD) by bioinformatics.MethodsUsing the microarray dataset GSE72267 from the Gene Expression Omnibus database, which included 40 blood samples from PD patients and 19 matched controls, differentially expressed genes (DEGs) were identified after data preprocessing, followed by Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway enrichment analyses. Protein-protein interaction (PPI) network, microRNA- (miRNA-) target regulatory network, and transcription factor- (TF-) target regulatory networks were constructed.ResultsOf 819 DEGs obtained, 359 were upregulated and 460 were downregulated. Two GO terms, "rRNA processing" and "cytoplasm," and two KEGG pathways, "metabolic pathways" and "TNF signaling pathway," played roles in PD development. Intercellular adhesion molecule 1 (ICAM1) was the hub node in the PPI network; hsa-miR-7-5p, hsa-miR-433-3p, and hsa-miR-133b participated in PD pathogenesis. Six TFs, including zinc finger and BTB domain-containing 7A, ovo-like transcriptional repressor 1, GATA-binding protein 3, transcription factor dp-1, SMAD family member 1, and quiescin sulfhydryl oxidase 1, were related to PD.Conclusions"rRNA processing," "cytoplasm," "metabolic pathways," and "TNF signaling pathway" were key pathways involved in PD. ICAM1, hsa-miR-7-5p, hsa-miR-433-3p, hsa-miR-133b, and the abovementioned six TFs might play important roles in PD development.

Bilimsel değerlendirme

Araştırma sorusu

Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.

Yöntem ve örneklem

Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.

Temel bulgular

Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.

Sınırlılıklar

Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.

Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.