SCIENTIFIC HUB

Araştırmanın izini sürün.

SCIENTIFIC LITERATURE · MED

Tirozil-DNA fosfodiesteraz 2 kodlama bölgesinde bir iç ribozom giriş sitesi alternatif çeviri başlangıcını yönlendirir.

An internal ribosome entry site in the coding region of tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2 drives alternative translation start.

Makine çevirisi · Editoryal inceleme bekliyor

J Biol Chem · 2018-12-28

DOI: 10.1074/jbc.ra118.006269PMID: 30593505

Erişim kaynaktan kontrol edilmeliResearch Support, Non-U.S. Gov't; research-article; Journal Article; Research Support, N.I.H., ExtramuralKaynağa git ↗

Araştırma özeti

Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by

Tyrosyl-DNA fosfodiesteraz 2 (TDP2), sayısız hücresel yolaklarda yer alan çok işlevli bir proteindir. En iyi bilinen fosfodiesteraz aktivitesi, durağan topoizomeraz 2'yi DNA'dan uzaklaştırsa da, TDP2'nin hem hayatta kalma hem de apoptotik mitojenle aktive protein kinaz (MAPK) sinyalleme kaskadı ile etkileşime girdiği gösterilmiştir. Dahası, enterovirüs replikasyonunu kolaylaştırır ve Parkinson hastalığından disleksiye kadar değişen nörolojik bozukluklarla genetik olarak bağlantılıdır. TDP2'yi terapötik bir hedef olarak doğru bir şekilde değerlendirmek için, TDP2'nin bu kadar geniş bir işlev çeşitliliğini nasıl gerçekleştirdiğini anlamamız gerekir. Burada, CRISPR/Cas9 veya kararlı bir şekilde ifade edilen TDP2 hedefli shRNA ile değiştirilen kanser hücre çizgilerini ve çeşitli TDP2 mutantlarının transfeksiyonunu kullanarak, ifadesinin, TDP2 kodlama dizisinin ikinci inframe metionin olan codon 54'te çeviriyi başlatan dahili bir ribozom giriş sitesi (IRS) aracılığıyla çeviri düzeyinde düzenlendiğini göstermek için kullanıyoruz. Bu IRES'in, bir nükleer lokalizasyon dizisini atlayan daha kısa, N-terminal olarak kesilmiş bir TDP2, DeltaN-TDP2 izoformunun ekspresyonunu yönlendirdiğini gözlemledik. Ek olarak, DeltaN-TDP2'nin fosfodiesteraz aktivitesini koruduğunu ve etoposide bağlı hücre ölümüne karşı koruyucu olduğunu, ancak daha az yüksek molekül ağırlıklı ubikuitine sahip peptit türleriyle birlikte immünopresipitatların TDP2'nin ubikitin-bağımlılık alanının kısmi işlev kaybı olduğunu öne sürdüğünü belirttik. Özetle, bulgularımız, TDP2'nin 5' kodlama dizisinde, TDP2'nin N-terminal olarak kesilmiş, sitoplazmik izoformunun ekspresyonunu düzenleyen bir IRES'in varlığını göstermektedir. Bu sonuçlar bu çok fonksiyonlu proteinin düzenlenmesine ışık tutar ve TDP2 ve ilişkili yolları hedefleyen terapilerin tasarımını bilgilendirebilir.

Özgün kaynak özetini okuyun

Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2 (TDP2) is a multifunctional protein that has been implicated in a myriad of cellular pathways. Although most well-known for its phosphodiesterase activity removing stalled topoisomerase 2 from DNA, TDP2 has also been shown to interact with both survival and apoptotic mitogen-activated protein kinase (MAPK) signaling cascades. Moreover, it facilitates enterovirus replication and has been genetically linked to neurological disorders ranging from Parkinson's disease to dyslexia. To accurately evaluate TDP2 as a therapeutic target, we need to understand how TDP2 performs such a wide diversity of functions. Here, we use cancer cell lines modified with CRISPR/Cas9 or stably-expressed TDP2-targeted shRNA and transfection of various TDP2 mutants to show that its expression is regulated at the translational level via an internal ribosome entry site (IRES) that initiates translation at codon 54, the second in-frame methionine of the TDP2 coding sequence. We observed that this IRES drives expression of a shorter, N-terminally truncated isoform of TDP2, ΔN-TDP2, which omits a nuclear localization sequence. Additionally, we noted that ΔN-TDP2 retains phosphodiesterase activity and is protective against etoposide-induced cell death, but co-immunoprecipitates with fewer high-molecular-weight ubiquitinated peptide species, suggesting partial loss-of-function of TDP2's ubiquitin-association domain. In summary, our findings suggest the existence of an IRES in the 5' coding sequence of TDP2 that translationally regulates expression of an N-terminally truncated, cytoplasmic isoform of TDP2. These results shed light on the regulation of this multifunctional protein and may inform the design of therapies targeting TDP2 and associated pathways.

Bilimsel değerlendirme

01

Araştırma sorusu

Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.

02

Yöntem ve örneklem

Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.

03

Temel bulgular

Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.

04

Sınırlılıklar

Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.

Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.