NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Benzer çevresel risk faktörleri, farklı hastalıkların paylaştığı patogenezin altında yatan ortak epigenetik mekanizmaların varlığını gösteren farklı nöropsikiyatrik bozukluklara (büyük psikiyatrik ve nörodejeneratif hastalıklar dahil) dahil edilmiştir. Böyle bir ortaklığı araştırmak için, ölüm öncesi prefrontal korteks (PFC) veri kohortundan, altı farklı nöropsikiyatrik bozukluk-şizofrenya, bipolar bozukluk, majör depresyon, alkolizm, Alzheimer ve Parkinson'un sağlıklı kontrolleri olan bireylerden birkaç konsensüs ko-ifadesi ve ko-metilasyon imzasını tanımlayan denetimsiz bir hesaplama yaklaşımı uyguladık. Sonuçlarımız arasında, çoklu tip bozukluklarda tutarlı ve önemli hastalık ilişkisi gösteren güçlü bir şekilde ilişkili bir çift eş-ifade ve eş-metilasyon (E-M) imzası belirledik. Bu E-M imzası internöron belirteçleri için zenginleştirildi ve bu zenginleşmenin, örnekler arasında normal internöronların değişen subpopülasyon bolluğundan kaynaklanmasının olası olmadığını daha da gösterdik. Dahası, gen seti zenginleştirme analizi, bu E-M imzasında stresle ilgili biyolojik süreçlerin aşırı temsil edildiğini ortaya koydu. Bu nedenle, ekspresyon ve metilasyon profillerinin bütünleyici analizi, beyinde strese bağlı bir epigenetik mekanizmayı önermektedir ve bu da çoklu nöropsikiyatrik hastalıkların patogeneziyle ilişkili olabilir.
Özgün kaynak özetini okuyun
Similar environmental risk factors have been implicated in different neuropsychiatric disorders (including major psychiatric and neurodegenerative diseases), indicating the existence of common epigenetic mechanisms underlying the pathogenesis shared by different illnesses. To investigate such commonality, we applied an unsupervised computational approach identifying several consensus co-expression and co-methylation signatures from a data cohort of postmortem prefrontal cortex (PFC) samples from individuals with six different neuropsychiatric disorders-schizophrenia, bipolar disorder, major depression, alcoholism, Alzheimer's and Parkinson's-as well as healthy controls. Among our results, we identified a pair of strongly interrelated co-expression and co-methylation (E-M) signatures showing consistent and significant disease association in multiple types of disorders. This E-M signature was enriched for interneuron markers, and we further demonstrated that it is unlikely for this enrichment to be due to varying subpopulation abundance of normal interneurons across samples. Moreover, gene set enrichment analysis revealed overrepresentation of stress-related biological processes in this E-M signature. Our integrative analysis of expression and methylation profiles, therefore, suggests a stress-related epigenetic mechanism in the brain, which could be associated with the pathogenesis of multiple neuropsychiatric diseases.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.