İnsan Yaşlanması ve Nörodejenerasyonla İlgili Gen Ağlarını Yönlendiren Mikroglial Bir İmza.

Araştırma özeti

Aşağıdaki metin kaynak makalenin lisansı doğrulanmış orijinal özetidir. cc by

Aging is regarded as a major risk factor for neurodegenerative diseases. Thus, a better understanding of the similarities between the aging process and neurodegenerative diseases at the cellular and molecular level may reveal better understanding of this detrimental relationship. In the present study, we mined publicly available gene expression datasets from healthy individuals and patients affected by neurodegenerative diseases (Alzheimer's disease, Parkinson's disease, and Huntington's disease) across a broad age spectrum and compared those with mouse aging and mouse cell-type specific gene expression profiles. We performed weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) and found a gene network strongly related with both aging and neurodegenerative diseases. This network was significantly enriched with a microglial signature as imputed from cell type-specific sequencing data. Since mouse models are extensively used for the study of human diseases, we further compared these human gene regulatory networks with age-specific mouse brain transcriptomes. We discovered significantly preserved networks with both human aging and human disease and identified 17 shared genes in the top-ranked immune/microglia module, among which we found five human hub genes TYROBP, FCER1G, ITGB2, MYO1F, PTPRC, and two mouse hub genes Trem2 and C1qa. Taken together, these results support the hypothesis that microglia are key players involved in human aging and neurodegenerative diseases, and suggest that mouse models should be appropriate for studying these microglial changes in human.

Türkçe çeviri

Makine çevirisi · Klinik kullanım öncesinde kaynakla karşılaştırılmalı.

Yaşlanma, nörodejeneratif hastalıklar için önemli bir risk faktörü olarak kabul edilir. Bu nedenle, yaşlanma süreci ile hücresel ve moleküler düzeyde nörodejeneratif hastalıklar arasındaki benzerliklerin daha iyi anlaşılması, bu zararlı ilişkinin daha iyi anlaşılmasını ortaya çıkarabilir. Bu çalışmada, geniş bir yaş spektrumu boyunca sağlıklı bireylerden ve nörodejeneratif hastalıklardan (Alzheimer hastalığı, Parkinson hastalığı ve Huntington hastalığı) etkilenen hastalardan elde edilen halka açık gen ekspresyonu veri kümelerini çıkardık ve fare yaşlanması ve fare hücresi tipi spesifik gen ekspresyon profillerine sahip olanları karşılaştırdık. Ağırlıklı gen eş ekspresyonu ağ analizi (WGCNA) yaptık ve hem yaşlanma hem de nörodejeneratif hastalıklarla güçlü bir şekilde ilişkili bir gen ağı bulduk. Bu ağ, hücre tipine özgü sıralama verilerinden elde edilen mikroglial imza ile önemli ölçüde zenginleştirildi. Fare modelleri insan hastalıklarının incelenmesinde yaygın olarak kullanıldığından, bu insan gen düzenleyici ağlarını yaşa özgü fare beyin transkriptomları ile daha da karşılaştırdık. Hem insan yaşlanması hem de insan hastalığı ile önemli ölçüde korunmuş ağlar keşfettik ve üst sıralarda yer alan bağışıklık/mikroglia modülünde 17 ortak gen tespit ettik, bunlar arasında beş insan hub geni TYROBP, FCIER1G, ITGB2, MYO1F, PTPRC ve iki fare hub geni Trem2 ve C1qa bulduk. Birlikte ele alındığında, bu sonuçlar mikroglianın insan yaşlanması ve nörodejeneratif hastalıklarda rol alan önemli oyuncular olduğu hipotezini destekliyor ve fare modellerinin insandaki bu mikroglial değişiklikleri incelemek için uygun olması gerektiğini öne sürüyor.

İlgili konular