NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Parkinson hastalığı (PD) ve Alzheimer hastalığı (AD) en yaygın nörodejeneratif hastalıklardır ve ortak patolojik ve fizyolojik bağlantıları paylaştığı öne sürülmüştür. Aralarındaki çapraz konuşmayı anlamak, erken teşhis ve terapötik müdahale için yeni stratejilerin geliştirilmesi için potansiyelleri ortaya çıkarabilir ve böylece etkilenenlerin yaşam kalitesini artırabilir. Burada, bugüne kadar bu tür çalışmalar için en büyük kohort olan 69 PD ve 57 kontrol beyin örneklerinden oluşan PD mikroarray veri kümelerinde diferansiyel olarak ifade edilen genleri (DEG'leri) tanımlamak için yeni bir meta-analiz gerçekleştirdik. Tanımlanmış DEG'leri kullanarak, yol, yukarı akış ve protein-protein etkileşim analizi yaptık. PD'de çoğunluğu (739/1046) azalan 1046 DEG tespit ettik. YWHAZ ve 14-3-3 proteinlerini kodlayan diğer genler, sinyal yollarında ve protein-protein etkileşim ağlarında (PPIN) önemli DEG'ler olarak tanımlanmaktadır. Perturbed pathways ayrıca mitokondriyal disfonksiyon ve oksidatif stres içerir. DEG'lerde PD ve AD arasında önemli bir örtüşme vardı ve bunların %99'undan fazlası hastalıklar boyunca aynı yukarı veya aşağı yönde diferansiyel olarak ifade edildi. REST, her iki hastalıkta da bir yukarı akım düzenleyicisi olarak tanımlandı. Çalışmamız, PD ve AD'nin önemli ortak DEG'leri ve yolları paylaştığını ve her iki hastalıkta da terapi için önemli hedefler olabilecek yeni genleri, yolları ve yukarı akım düzenleyicilerini tanımladığını göstermektedir.
Özgün kaynak özetini okuyun
Parkinson's disease (PD) and Alzheimer's disease (AD) are the most common neurodegenerative diseases and have been suggested to share common pathological and physiological links. Understanding the cross-talk between them could reveal potentials for the development of new strategies for early diagnosis and therapeutic intervention thus improving the quality of life of those affected. Here we have conducted a novel meta-analysis to identify differentially expressed genes (DEGs) in PD microarray datasets comprising 69 PD and 57 control brain samples which is the biggest cohort for such studies to date. Using identified DEGs, we performed pathway, upstream and protein-protein interaction analysis. We identified 1046 DEGs, of which a majority (739/1046) were downregulated in PD. YWHAZ and other genes coding 14-3-3 proteins are identified as important DEGs in signaling pathways and in protein-protein interaction networks (PPIN). Perturbed pathways also include mitochondrial dysfunction and oxidative stress. There was a significant overlap in DEGs between PD and AD, and over 99% of these were differentially expressed in the same up or down direction across the diseases. REST was identified as an upstream regulator in both diseases. Our study demonstrates that PD and AD share significant common DEGs and pathways, and identifies novel genes, pathways and upstream regulators which may be important targets for therapy in both diseases.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.