NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
DJ-1 gen mutasyonunun neden olduğu düşük DJ-1 protein seviyesi, bozulmuş antioksidatif aktivite nedeniyle otozomal resesif Parkinson hastalığına (PD) yol açar. Sporadik PD hastalarında, mutasyonlar nadiren bulunsa da, daha düşük DJ-1 protein seviyesi de bildirilmiştir. DJ-1 gen ekspresyonunun disregülasyonu düşük DJ-1 protein seviyesine katkıda bulunabilir. Promotör gen ekspresyonunu başlatmak için en önemli unsur olduğundan, DJ-1 promotöründeki polimorfizmlerin gen ekspresyonunun disregülasyonuyla sonuçlanıp sonuçlanmadığı, böylece düşük protein seviyesine yol açtığı ve PD'ye neden olduğu araştırılmaya değerdir. DJ-1 promotör bölgesi, DJ-1 promotör polimorfizmleri, PD riski ve klinik fenotipler arasındaki olası bağlantıları değerlendirmek için Çinli bir kohortta sıralandı. Çift lüsiferaz muhabir tahlili, promotör polimorfizmlerin DJ-1 transkripsiyonel aktivitesi üzerindeki etkisini değerlendirmek için yapılmıştır. Mevcut genom çapında bir dernek çalışması (GWAS) veritabanındaki ilgili bilgiler araştırıldı, mevcut çalışmanın meta-analizi ve önceki diğer raporlar yapıldı ve derneği daha fazla araştırmak için nicel özellik loci (eQTL) analizi yapıldı. Kohortumuzda üç tek nükleotid polimorfizmi (SNPs) (rs17523802, rs226249 ve rs35675666) ve bir 18 bp silme (rs200968609) gözlenmiştir. Bununla birlikte, tespit edilen dört genetik varyasyon ile alelik veya genotip modelinde, tek nokta analizinde veya haplotip analizinde PD riski arasında önemli bir ilişki yoktu. Bu, bu çalışmanın meta-analizi ve önceki raporların yanı sıra GWAS veritabanı PDGene tarafından desteklenmektedir. Dual luciferase muhabiri tahlili, bu promoter polimorfizmlerin, GTEx veritabanından elde edilen verileri kullanan eQTL analiz sonuçlarıyla tutarlı olan DJ-1 transkriptif etkinliği üzerinde hiçbir etkisi olmadığını öne sürdü. Bu nedenle, DJ-1 promoter polimorfizmleri, sporadik PD'de DJ-1 ekspresyonunun ve PD duyarlılığının disregülasyonunda çok az rol oynayabilir.
Özgün kaynak özetini okuyun
Low DJ-1 protein level caused by DJ-1 gene mutation leads to autosomal recessive Parkinson's disease (PD) due to impaired antioxidative activity. In sporadic PD patients, although mutations were rarely found, lower DJ-1 protein level was also reported. Dysregulation of DJ-1 gene expression might contribute to low DJ-1 protein level. Since the promoter is the most important element to initiate gene expression, whether polymorphisms in the DJ-1 promoter result in the dysregulation of gene expression, thus leading to low protein level and causing PD, is worth exploring. The DJ-1 promoter region was sequenced in a Chinese cohort to evaluate possible links between DJ-1 promoter polymorphisms, PD risk and clinical phenotypes. Dual-luciferase reporter assay was conducted to evaluate the influence of promoter polymorphisms on DJ-1 transcriptional activity. Related information in an existing genome-wide association studies (GWAS) database were looked up, meta-analysis of the present study and other previous reports was conducted, and expression quantitative trait loci (eQTL) analysis was performed to further explore the association. Three single nucleotide polymorphisms (SNPs) (rs17523802, rs226249, and rs35675666) and one 18 bp deletion (rs200968609) were observed in our cohort. However, there was no significant association between the four detected genetic variations and the risk of PD either in allelic or genotype model, in single-point analysis or haplotype analysis. This was supported by the meta-analysis of this study and previous reports as well as that of GWAS database PDGene. Dual luciferase reporter assay suggested these promoter polymorphisms had no influence on DJ-1 transcriptive activity, which is consistent with the eQTL analysis results using the data from GTEx database. Thus, DJ-1 promoter polymorphisms may play little role in the dysregulation of DJ-1 expression and PD susceptibility in sporadic PD.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.