NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
MikroRNA'ların (miRNA'ların) Parkinson hastalığının patofizyolojisine (PD), yaşa bağlı nörodejeneratif bir bozukluğa katkıda bulunduğu bildirilmiştir. Bu çalışmanın amacı, sağlıklı kontrolleri olan PD hastalarından elde edilen periferik kan mononükleer hücrelerde (PBMC'ler) yaşlanma ve hücresel senescence ile ilgili yeni bir aday miRNA'ların ekspresyon profillerini karşılaştırmak ve daha sonra PD hastalarının erken ve ileri aşamalarında ekspresyonlarının hastalık şiddeti ile ilişkili olup olmadığını netleştirmek için kontrolleri ile karşılaştırmaktı. Ayrıca, PD insidansı sırasında moleküler düzenleyici değişiklikler hakkında daha iyi bir fikir edinmek için miRNA'ların ifade verilerini yorumlamak için fikir birliğine dayalı bir strateji önerdik. PD'li 36 hastadan ve 16 sağlıklı kontrolden elde edilen PBMC'lerde miRNA ekspresyon seviyelerini ters transkripsiyon-kuantatif gerçek zamanlı PCR ile değerlendirdik ve PD hastalarını alıcının karakteristik eğri analizi kullanılarak değerlendirilen sağlıklı deneklerden ayırt etme performanslarını değerlendirdik. Ayrıca, ilgili hedef ve transkripsiyon faktörleri ile PD'de deregüle miRNA tabanlı bir ağ oluşturmak için fikir birliği ve entegrasyon yaklaşımımızı uyguladık ve zenginleştirme analiz yaklaşımını kullanan zenginleştirilmiş gen ontolojisi ve yolları elde edildi. Kontrollere kıyasla miR-885 ve miR-17'nin aşırı ekspresyonu ve miR-361'in PD hastalarında düşük regülasyonu vardı. MiR-885 ve miR-17'nin kan ekspresyonu, hastalık şiddeti ile birlikte artmaya eğilimliydi. Öte yandan, PD hastalarının erken evrelerinde kontrollere kıyasla miR-361'in daha düşük seviyeleri ve PD hastalarının ileri evrelerinde PD hastalarının erken evrelerine kıyasla daha yüksek seviyeleri gözlenmiştir. Her üç miRNA'nın kombinasyonu, PD hastalarını sağlıklı deneklerden ayırt etmek için uygun bir AUC değeri (0.985) gösterdi. Ayrıca, deregülasyonlu miRNA'lar bilinen PD yollarına bağlıydı ve adayla ilgili hedef genler sunuldu. PD'li hastalarda ilk kez yaşlanma ve hücresel senesans ile ilgili 3 aday biyobelirteç ortaya çıkardık. In-siliko analizimiz, nörodejenerasyon ve PD ile ilgili olanlar da dahil olmak üzere aday hedef genleri ve TF'leri tanımladı. Genel olarak, bulgularımız, PD'nin altında yatan olası yaş düzenleyici mekanizmalar ve PD patogenezindeki tanımlanmış miRNA'ların rolünü daha da netleştirmek için bir gerekçe hakkında yeni bilgiler sağladı.
Özgün kaynak özetini okuyun
MicroRNAs (miRNAs) have been reported to contribute to the pathophysiology of the Parkinson's disease (PD), an age related-neurodegenerative disorder. The aim of present study was to compare the expression profiles of a new set of candidate miRNAs related to aging and cellular senescence in peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) obtained from the PD patients with healthy controls and then in the early and advanced stages of the PD patients with their controls to clarify whether their expression was correlated with the disease severity. We have also proposed a consensus-based strategy to interpret the miRNAs expression data to gain a better insight into the molecular regulatory alterations during the incidence of PD. We evaluated the miRNA expression levels in the PBMCs obtained from 36 patients with PD and 16 healthy controls by the reverse transcription-quantitative real-time PCR and their performance to discriminate the PD patients from the healthy subjects assessed using the receiver operating characteristic curve analysis. Also, we applied our consensus and integration approach to construct a deregulated miRNA-based network in PD with the respective targets and transcription factors, and the enriched gene ontology and pathways using the enrichment analysis approach were obtained. There was a significant overexpression of miR-885 and miR-17 and the downregulation of miR-361 in the PD patients compared to the controls. The blood expression of miR-885 and miR-17 tended to increase along with the disease severity. On the other hand, the lower levels of miR-361 in the early stages of the PD patients, as compared to controls, and its higher levels in the advanced stages of PD patients, as compared to the early stages of the PD patients, were observed. Combination of all three miRNAs showed an appropriate value of AUC (0.985) to discriminate the PD patients from the healthy subjects. Also, the deregulated miRNAs were linked to the known PD pathways and the candidate related target genes were presented. We revealed 3 candidate biomarkers related to aging and cellular senescence for the first time in the patients with PD. Our in-silico analysis identified candidate target genes and TFs, including those related to neurodegeneration and PD. Overall, our findings provided novel insights into the probable age-regulatory mechanisms underlying PD and a rationale to further clarify the role of the identified miRNAs in the PD pathogenesis.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.