NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Amaçlar Postmenopozal osteoporozda ubiquitinasyon mekanizmalarını belirlemek ve sağlıklı postmenopozal kadınlar ile postmenopozal osteoporoz hastaları arasındaki yeni hedeflerin ubiquitinated spektrumunu araştırmak için, postmenopozal kadınların ve postmenopozal osteoporoz hastalarının tüm kanının ubiquitylome analizini yaptık.Metodlar postmenopozal osteoporoz mekanizmasının daha kapsamlı bir anlayışını elde etmek için, yedi sağlıklı kadından tüm kandaki ubiquitylome'nin nicelumunu yaptık. Ubiquitylome verilerini incelemek için, bir ubiquitilated amino asit motifi, Gene Ontology (GO) ve Kyoto Genler ve Genomlar Ansiklopedisi (KEGGG) yolunu kullanarak zenginleştirme analizi yaptık.SonuçlarBirlikte, 133 ubiquitined site ve 102 protein niceleştirildi. 1,2 kattan daha fazla bir fark, önemli bir upregülasyon ve 0,83'ten az önemli bir düşüş olarak kabul edilir; 25 protein üzerindeki 32 ubikuitinatlı bölge upregulated edildi ve 77 proteindeki 101 ubikuitinatlı bölge downregulated edildi. Bu niceliklendirilmiş proteinler, hem farklı ubiquitinated sitelerle, hücresel süreçler, biyolojik düzenleme süreçleri, uyaran süreçlerine yanıt, tek-organizma ve metabolik süreçler gibi çeşitli hücresel süreçlere katıldılar. Enzim aktivitesini ve ubiquitin benzeri proteini konjugasyon yapan enzim aktivitesi, ilgili proteinlere sahip üst düzey bölgelerin moleküler fonksiyonunda en zenginleştirilmiş olanlardı, ancak bunlar, ilgili proteinlere sahip bölgelerde aşağı düzenlenmiş olarak zenginleştirilmediler. Farklılaşmış ubiquitined sitelerle niceleştirilmiş proteinlerin KEGG yolları analizi, glioksilat ve dekarboksilat metabolizması, dopaminerjik sinaps, ubiquitin aracılı proteoliz, tükürük salgısı, pıhtılaşma ve kaskatlar, Parkinson hastalığı ve hipopo sinyal yolu gibi 13 çeşit moleküler etkileşim ve fonksiyonel yol buldu. Buna ek olarak, hsa04120 ubiquitin aracılı proteoliz, upregüle edilmiş sitelerle proteinlerde en zenginleştirilmiş, hsa04610 tamamlayıcı ve pıhtılaşma basamakları, düşük regüle edilmiş postubiquitinli sitelerle proteinlerde en zenginleştirilmiş ve hsa04114 Oocyte meiosis, tüm diferansiyel proteinler arasında en zenginleştirilmiş ve kadın diferansiyelinin anlaşılmasını genişleten çalışmadır. Bulgular, postmenopozal osteoporozda altta yatan proteostaz yollarını anlamamıza ve tüm kanda tanısal biyobelirteçlerin potansiyel tanımlanmasına katkıda bulunacaktır.
Özgün kaynak özetini okuyun
ObjectivesTo determine the mechanisms of ubiquitination in postmenopausal osteoporosis and investigate the ubiquitinated spectrum of novel targets between healthy postmenopausal women and postmenopausal osteoporosis patients, we performed ubiquitylome analysis of the whole blood of postmenopausal women and postmenopausal osteoporosis patients.MethodsTo obtain a more comprehensive understanding of the postmenopausal osteoporosis mechanism, we performed a quantitative assessment of the ubiquitylome in whole blood from seven healthy postmenopausal women and seven postmenopausal osteoporosis patients using high-performance liquid chromatography fractionation, affinity enrichment, and liquid chromatography coupled to tandem mass spectrometry (LC-MS/MS). To examine the ubiquitylome data, we performed enrichment analysis using an ubiquitylated amino acid motif, Gene Ontology (GO) and the Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway.ResultsAltogether, 133 ubiquitinated sites and 102 proteins were quantified. A difference of more than 1.2 times is considered significant upregulation and less than 0.83 significant downregulation; 32 ubiquitinated sites on 25 proteins were upregulated and 101 ubiquitinated sites on 77 proteins were downregulated. These quantified proteins, both with differently ubiquitinated sites, participated in various cellular processes, such as cellular processes, biological regulation processes, response to stimulus processes, single-organism and metabolic processes. Ubiquitin conjugating enzyme activity and ubiquitin-like protein conjugating enzyme activity were the most highly enriched in molecular function of upregulated sites with corresponding proteins, but they were not enriched in downregulated in sites with corresponding proteins. The KEGG pathways analysis of quantified proteins with differentiated ubiquitinated sites found 13 kinds of molecular interactions and functional pathways, such as glyoxylate and decarboxylate metabolism, dopaminergic synapse, ubiquitin-mediated proteolysis, salivary secretion, coagulation and complement cascades, Parkinson's disease, and hippo signaling pathway. In addition, hsa04120 ubiquitin-mediated proteolysis was the most highly enriched in proteins with upregulated sites, hsa04610 complement and coagulation cascades was the most highly enriched in proteins with downregulated ubiquitinated sites, and hsa04114 Oocyte meiosis was the most highly enriched among all differential proteins.ConclusionOur study expands the understanding of the spectrum of novel targets that are differentially ubiquitinated in whole blood from healthy postmenopausal women and postmenopausal osteoporosis patients. The findings will contribute toward our understanding of the underlying proteostasis pathways in postmenopausal osteoporosis and the potential identification of diagnostic biomarkers in whole blood.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.