Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Parkinson Hastalığı (PD) ile yakından ilişkili dolaşımdaki biyobelirteçlerin tanımlanması geçmişte birkaç kez başarısız olmuştur. Bununla birlikte, bu pilot çalışmada, PD hastalarını eşleştirilmiş kontrollerden ayırt etmek için potansiyel tanı değeri olan sağlam bir modele yol açan iki mitokondriyal ilişkili proteinin plazma seviyelerinin değerlendirilmesine izin veren bir çevirisel yaklaşım gerçekleştirildi.MetodlarÖnerilen çevirisel yaklaşım, kontrol altında kültürlenen hücrelerden veya iyi tanımlanmış oksidatif stres koşullarından salgıların analiziyle başlatıldı ve ardından iki durum arasında değişen PD patolojik mekanizmalarla ilgili proteinlerin tanımlanmasıyla takip edildi. Bu boru hattı, 28 kontrol ve 31 PD hastalarından tükenmemiş plazma örneklerinin analizine daha da çevrildi.SonuçlarSecretome analizinden, birkaç mitokondri ile ilgili proteinin kontrol ve stres koşulları arasında diferansiyel olarak salındığı ve iki sekromu ayırt edebildiği bulundu. Benzer şekilde, iki mitokondriyal ilişkili proteinin, eşleştirilmiş kontrollere kıyasla bir PD kohortunda önemli ölçüde değiştirildiği bulunmuştur. Ayrıca, PD hastalarını ayırt etmek için potansiyel tanı değeri olan doğrusal bir diskriminant model, bu iki proteinin kombinasyonu kullanılarak elde edilmiştir. Her iki protein de apoptotik mitokondriyal değişikliklerle ilişkilidir, bu da hücre ölümünün potansiyel göstergelerine karşılık gelebilir. Dahası, bu proteinlerden biri, VPS35 proteini, ilk kez plazmada rapor edildi ve niceliği ancak secretome analizinde önceki tanımlaması nedeniyle mümkün oldu.Bu çalışmada, biyobelirteç seçimi için bir çeviri boru hattının bir uyarlaması sunuldu ve mevcut durumda Parkinson Hastalığı'na nörolojik hastalıklara aktarıldı. Bu pilot çalışmanın yeniliği ve başarısı, aşağıdakilerin birleşiminden kaynaklanabilir: i) plazma örneklerinin daha önce oksidatif stres altında hücrelerin sekresyonunun değerlendirilmesinden elde edilen bilgiler kullanılarak sorgulandığı çevirisel bir araştırma boru hattı; ii) istatistiksel analizin bir araya getirilmesi ve ilgili hastalık mekanizmalarıyla olan bağlantılarına dayanarak adayların bilinçli bir seçimi ve iii) daha önce tanımlanmış bir MS yöntemi olan ve analiz edilen bir verinin tam bir kaydını sağlayan hedefsiz bir MS yöntemi.
Özgün kaynak özetini okuyun
BackgroundThe identification of circulating biomarkers that closely correlate with Parkinson's Disease (PD) has failed several times in the past. Nevertheless, in this pilot study, a translational approach was conducted, allowing the evaluation of the plasma levels of two mitochondrial-related proteins, whose combination leads to a robust model with potential diagnostic value to discriminate the PD patients from matched controls.MethodsThe proposed translational approach was initiated by the analysis of secretomes from cells cultured under control or well-defined oxidative stress conditions, followed by the identification of proteins related to PD pathologic mechanisms that were altered between the two states. This pipeline was further translated into the analysis of undepleted plasma samples from 28 control and 31 PD patients.ResultsFrom the secretome analysis, several mitochondria-related proteins were found to be differentially released between control and stress conditions and to be able to distinguish the two secretomes. Similarly, two mitochondrial-related proteins were found to be significantly changed in a PD cohort compared to matched controls. Moreover, a linear discriminant model with potential diagnostic value to discriminate PD patients was obtained using the combination of these two proteins. Both proteins are associated with apoptotic mitochondrial changes, which may correspond to potential indicators of cell death. Moreover, one of these proteins, the VPS35 protein, was reported in plasma for the first time, and its quantification was only possible due to its previous identification in the secretome analysis.ConclusionsIn this work, an adaptation of a translational pipeline for biomarker selection was presented and transposed to neurological diseases, in the present case Parkinson's Disease. The novelty and success of this pilot study may arise from the combination of: i) a translational research pipeline, where plasma samples are interrogated using knowledge previously obtained from the evaluation of cells' secretome under oxidative stress; ii) the combined used of statistical analysis and an informed selection of candidates based on their link with relevant disease mechanisms, and iii) the use of SWATH-MS, an untargeted MS method that allows a complete record of the analyzed samples and a targeted data extraction of the quantitative values of proteins previously identified.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.