NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Parkinson hastalığı (PD) ikinci en yaygın nörodejeneratif hastalıktır ve bu hastalık üzerinde birçok çalışma yapılmış olmasına rağmen, altta yatan mekanizmalar hala yeterince anlaşılamamıştır ve daha ileri çalışmalar garanti edilmektedir. Bu nedenle, bu çalışma RNA dizilimi (RNA-seq) kullanılarak serebral korteks (CC), hipokampus (HP), striatum (ST) ve 1-metil-1,2,3,6-tetrahidropiridin (MPTP) kaynaklı PD fare modelinin beyincik (CB) bölgelerindeki circRNA ekspresyon profillerini tanımladı ve diferansiyel olarak ifade edilen circRNA, ters transkripsiyon nicel gerçek zamanlı PCR (qRT-PCR) kullanılarak doğrulandı. Gen ontolojisi (GO), Kyoto Genler ve Genomlar Ansiklopedisi (KEGG) yolu ve rakip endojen RNA (ceRNA) ağ analizleri de circRNA'ların potansiyel fonksiyonunu araştırmak için yapılmıştır. Sonuçlar, kontrol grubuyla karşılaştırıldığında, sırasıyla 24, 66, 71 ve 121 farklı şekilde ifade edilen circRNA'ların (DE-circRNA'lar) CC, HP, ST ve CB'de bulunduğunu göstermektedir. PDST vs. PDCB, PDST vs. PDHP ve PDCB vs. PDHP grupları sırasıyla 578, 110 ve 749 DE-circRNA'ya sahiptir. Ardından, qRT-PCR doğrulaması için yedi DE-cirRNA seçildi ve burada ifadeler sıralama analizi ile tutarlıydı. GO ve KEGG pathway analizleri, bu DE-circRNA'ların glutamik sinaps, nörondan nöron sinaps, nöron farklılaşmasında rol alan hücre morfogenezi, Parkinson hastalığı, akson rehberliği, cGMP-PKG sinyal yolu ve PI3K-Akt sinyal yolu dahil olmak üzere çeşitli biyolojik fonksiyonlara ve sinyal yollarına katıldığını ortaya koymuştur. Ayrıca, DE-circRNA'lar tarafından tahmin edilen hedef genlerin KEGG analizi, mmu_circRNA_0003292, mmu_circRNA_0001320, mmu_circRNA_0005976 ve mmu_circRNA_0005388 tarafından öngörülen hedef genlerin PD ile ilişkili yollara dahil olduğunu göstermiştir. Genel olarak, bu PD fare modelinin farklı beyin bölgelerindeki circRNA'ların ekspresyon profili üzerine ilk çalışmadır. Bu sonuçlar, PD patogenezindeki circRNA'ların potansiyel rollerini anlamamızı kolaylaştırabilir. Ayrıca, sonuçlar ayrıca, mmu_circRNA_0003292-miRNA-132-Nr4a2 yolunun Parkinson hastalığının moleküler mekanizmasının düzenlenmesinde rol oynayabileceğini göstermektedir.
Özgün kaynak özetini okuyun
Parkinson's disease (PD) is the second most common neurodegenerative disease and although many studies have been done on this disease, the underlying mechanisms are still poorly understood and further studies are warranted. Therefore, this study identified circRNA expression profiles in the cerebral cortex (CC), hippocampus (HP), striatum (ST), and cerebellum (CB) regions of the 1-methyl-1,2,3,6-tetrahydropyridine (MPTP)-induced PD mouse model using RNA sequencing (RNA-seq), and differentially expressed circRNA were validated using reverse transcription quantitative real-time PCR (qRT-PCR). Gene ontology (GO), Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway, and competing endogenous RNA (ceRNA) network analyses were also performed to explore the potential function of circRNAs. The results show that, compared with the control group, 24, 66, 71, and 121 differentially expressed circRNAs (DE-circRNAs) were found in the CC, HP, ST, and CB, respectively. PDST vs. PDCB, PDST vs. PDHP, and PDCB vs. PDHP groups have 578, 110, and 749 DE-circRNAs, respectively. Then, seven DE-cirRNAs were selected for qRT-PCR verification, where the expressions were consistent with the sequencing analysis. The GO and KEGG pathway analyses revealed that these DE-circRNAs participate in several biological functions and signaling pathways, including glutamic synapse, neuron to neuron synapse, cell morphogenesis involved in neuron differentiation, Parkinson's disease, axon guidance, cGMP-PKG signaling pathway, and PI3K-Akt signaling pathway. Furthermore, the KEGG analysis of the target genes predicted by DE-circRNAs indicated that the target genes predicted by mmu_circRNA_0003292, mmu_circRNA_0001320, mmu_circRNA_0005976, and mmu_circRNA_0005388 were involved in the PD-related pathway. Overall, this is the first study on the expression profile of circRNAs in the different brain regions of PD mouse model. These results might facilitate our understanding of the potential roles of circRNAs in the pathogenesis of PD. Moreover, the results also indicate that the mmu_circRNA_0003292-miRNA-132-Nr4a2 pathway might be involved in the regulation of the molecular mechanism of Parkinson's disease.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.