NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Lipidomikler, bozulmamış fosfolipidler (PL) ve yağlı akil zincir bileşimi hakkında hem yapısal bilgi elde etmek için hızlı hem de tekrarlanabilir araçların eksikliğinden muzdariptir. Elektrospray iyonizasyonu ile birlikte hidrofilik etkileşim sıvı kromatografisi, tüm iyon parçalanma modunu (HILIC-ESI-FTMS-AIF MS) kullanarak çalışan orbital tuzak Fourier-transform analizöre bağlı olarak, bu açıdan değerli bir kaynak olarak görünmektedir. Burada, doğru m/z değerleri, HILIC tutma süreleri ve AIF MS tarama verileri standart karışımlarda veya gerçek lipid ekstraktlarında PL ataması için birleştirildi. Hem pozitif hem de negatif ESI modunda AIF taramaları, parçalanma için çarpışmaya neden olan ayrışma kullanılarak elde edildi, sırasıyla her PL sınıfının baş grubunu ve yağlı akil zincirlerini tanımlamak için uygulandı. AIF yaklaşımının bir avantajı, tandem MS benzeri verilerin eşzamanlı toplanmasıydı ve buna karşılık gelen karboksilat anyonları aracılığıyla öncü fosfolipidlerin bağlı yağlı akil zincirlerinin tanımlanmasını sağladı. AIF'nin lipidomiği alanındaki yeteneğini göstermek için, iki farklı gerçek örnek türü, yani insan plazması ve dermal fibroblastlardan elde edilen lipid özleri incelenmiştir. AIF taramaları kullanılarak, plazma örneklerinde toplam 253 bozulmamış lipid türü ve 4 lipid sınıfı boyunca 18 yağ asidi bulunurken, FA C20:3, Parkinson hastalığı hastalarının fibroblast örneklerinde aşağı doğru regüle olduğu tespit edilen PI 38:3, fosfatidilinositol'e ait yağlı akil zinciri olarak doğrulandı.
Özgün kaynak özetini okuyun
Lipidomics suffers from the lack of fast and reproducible tools to obtain both structural information on intact phospholipids (PL) and fatty acyl chain composition. Hydrophilic interaction liquid chromatography with electrospray ionization coupled to an orbital-trap Fourier-transform analyzer operating using all ion fragmentation mode (HILIC-ESI-FTMS-AIF MS) is seemingly a valuable resource in this respect. Here, accurate m/z values, HILIC retention times and AIF MS scan data were combined for PL assignment in standard mixtures or real lipid extracts. AIF scans in both positive and negative ESI mode, achieved using collisional induced dissociation for fragmentation, were applied to identify both the head-group of each PL class and the fatty acyl chains, respectively. An advantage of the AIF approach was the concurrent collection of tandem MS-like data, enabling the identification of linked fatty acyl chains of precursor phospholipids through the corresponding carboxylate anions. To illustrate the ability of AIF in the field of lipidomics, two different types of real samples, i.e., the lipid extracts obtained from human plasma and dermal fibroblasts, were examined. Using AIF scans, a total of 253 intact lipid species and 18 fatty acids across 4 lipid classes were recognized in plasma samples, while FA C20:3 was confirmed as the fatty acyl chain belonging to phosphatidylinositol, PI 38:3, which was found to be down-regulated in fibroblast samples of Parkinson's disease patients.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.