NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
AmaçYeni nesil sıralama (NGS) tekniklerindeki gelişmeler hızlı, verimli ve uygun maliyetli genetik varyant tespitine olanak sağlamıştır. Bununla birlikte, hem klinik uygulamada hem de araştırma ortamında, sıralama hala sıklıkla ilgi hastalığının altında yatan genleri klinik olarak hedef alan gen panellerinin kullanımı ile sınırlıdır.MetodlarFarklı tipte dejeneratif bilişsel bozukluklara sahip 8 hastada 16 geni taramak için ad hoc NGS tabanlı özel sıralama gen paneli aracılığıyla bir nörogenetik çalışma yaptık (Alzheimer hastalığı, hafif bilişsel bozukluk, frontotemporal demans ve bunama ile ilişkili). Çalışma protokolü, panelin bazı hotspot eksonları ile sınırlı olduğu zamanlarda bile tekniğin yüksek duyarlılığını ve özgüllüğünü gösteren önceki kanıtlara dayanıyordu.SonuçlarTREM2 ve APP genlerinin varyantlarını üç hastada bulduk; bunlar daha önce patojenik veya muhtemelen patojenik olarak tanımlanmış ve bu nedenle "hastalığa neden" olarak kabul edilmiştir. Kalan deneklerde, patojenlik Amerikan Tıp Koleji'nin (ACMG) yönergelerine göre değerlendirildi. Bir hastada CHMP2B genindeki p.R205W varyantının muhtemelen hastalığın patojenik olduğu bulunmuştur. İki hastada bulunan CSF1R ve SERPINI1 genlerinde bir varyant iyi huylu olarak sınıflandırılırken, diğer ikisi (GRN ve APP genlerinde) ACMG'ye göre olası patojenik olarak sınıflandırıldı.Bu çalışmanın ön değerine dayanmayan, olası bir hastalık ilişkisine sahip bazı nadir genetik varyantlar tespit edildi. NGS tabanlı sensörlerin gelecekteki uygulamaları ve bu deneysel verilerin daha fazla çoğaltılmasına ihtiyaç duyulsa da, bu yaklaşım, çok çeşitli nörodejeneratif bozuklukların teşhisi ve yönetiminde umut verici çeviri perspektifleri sunuyor gibi görünmektedir.
Özgün kaynak özetini okuyun
PurposeThe advancements in the next-generation sequencing (NGS) techniques have allowed for rapid, efficient, and cost-time-effective genetic variant detection. However, in both clinical practice and research setting, sequencing is still often limited to the use of gene panels clinically targeted on the genes underlying the disease of interest.MethodsWe performed a neurogenetic study through an ad hoc NGS-based custom sequencing gene panel in order to screen 16 genes in 8 patients with different types of degenerative cognitive disorders (Alzheimer's disease, mild cognitive impairment, frontotemporal dementia, and dementia associated with Parkinson's disease). The study protocol was based on previous evidence showing a high sensitivity and specificity of the technique even when the panel is limited to some hotspot exons.ResultsWe found variants of the TREM2 and APP genes in three patients; these have been previously identified as pathogenic or likely pathogenic and, therefore, considered "disease causing." In the remaining subjects, the pathogenicity was evaluated according to the guidelines of the American College of Medical Genetics (ACMG). In one patient, the p.R205W variant in the CHMP2B gene was found to be likely pathogenic of the disease. A variant in the CSF1R and SERPINI1 genes found in two patients was classified as benign, whereas the other two (in the GRN and APP genes) were classified as likely pathogenic according to the ACMG.ConclusionsNotwithstanding the preliminary value of this study, some rare genetic variants with a probable disease association were detected. Although future application of NGS-based sensors and further replication of these experimental data are needed, this approach seems to offer promising translational perspectives in the diagnosis and management of a wide range of neurodegenerative disorders.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.