Peptid/Protein Öz-Assembly ve Agregasyonun Spektroskopik Yöntemlerle Değerlendirilmesi.

Araştırma özeti

Aşağıdaki metin kaynak makalenin lisansı doğrulanmış orijinal özetidir. cc by

The self-assembly of proteins is an essential process for a variety of cellular functions including cell respiration, mobility and division. On the other hand, protein or peptide misfolding and aggregation is related to the development of Parkinson's disease and Alzheimer's disease, among other aggregopathies. As a consequence, significant research efforts are directed towards the understanding of this process. In this review, we are focused on the use of UV-Visible Absorption Spectroscopy, Fluorescence Spectroscopy and Circular Dichroism to evaluate the self-organization of proteins and peptides in solution. These spectroscopic techniques are commonly available in most chemistry and biochemistry research laboratories, and together they are a powerful approach for initial as well as routine evaluation of protein and peptide self-assembly and aggregation under different environmental stimulus. Furthermore, these spectroscopic techniques are even suitable for studying complex systems like those in the food industry or pharmaceutical formulations, providing an overall idea of the folding, self-assembly, and aggregation processes, which is challenging to obtain with high-resolution methods. Here, we compiled and discussed selected examples, together with our results and those that helped us better to understand the process of protein and peptide aggregation. We put particular emphasis on the basic description of the methods as well as on the experimental considerations needed to obtain meaningful information, to help those who are just getting into this exciting area of research. Moreover, this review is particularly useful to those out of the field who would like to improve reproducibility in their cellular and biomedical experiments, especially while working with peptide and protein systems as an external stimulus. Our final aim is to show the power of these low-resolution techniques to improve our understanding of the self-assembly of peptides and proteins and translate this fundamental knowledge in biomedical research or food applications.

Türkçe çeviri

Makine çevirisi · Klinik kullanım öncesinde kaynakla karşılaştırılmalı.

Proteinlerin kendiliğinden bir araya gelmesi, hücre solunumu, hareketlilik ve bölünme dahil olmak üzere çeşitli hücresel işlevler için gerekli bir süreçtir. Öte yandan, protein veya peptit yanlış katlama ve agregasyon, Parkinson hastalığı ve Alzheimer hastalığının gelişimi ile ilişkilidir, diğer agregopatiler arasında. Sonuç olarak, bu sürecin anlaşılması için önemli araştırma çabaları yönlendirilir. Bu incelemede, çözeltideki protein ve peptidlerin kendi kendine düzenlenmesini değerlendirmek için UV-Görünür Absorpsiyon Spektroskopisi, Floresans Spektroskopisi ve Dairesel Dikroizm kullanımına odaklandık. Bu spektroskopik teknikler çoğu kimya ve biyokimya araştırma laboratuvarında yaygın olarak bulunur ve birlikte, protein ve peptid kendi kendine montaj ve agregasyonun farklı çevresel uyaranlar altında rutin olarak değerlendirilmesi gibi başlangıç için güçlü bir yaklaşımdır. Dahası, bu spektroskopik teknikler, gıda endüstrisindekiler veya farmasötik formülasyonlar gibi karmaşık sistemleri incelemek için bile uygundur ve yüksek çözünürlüklü yöntemlerle elde edilmesi zor olan katlama, kendi kendine montaj ve toplama süreçleri hakkında genel bir fikir sağlar. Burada, seçilmiş örnekleri, sonuçlarımız ve protein ve peptid toplama sürecini daha iyi anlamamıza yardımcı olanlarla birlikte derledik ve tartıştık. Yöntemlerin temel tanımına ve anlamlı bilgi elde etmek için gereken deneysel düşüncelere, bu heyecan verici araştırma alanına yeni girenlere yardımcı olmak için özellikle önem veriyoruz. Dahası, bu inceleme, özellikle peptit ve protein sistemleri ile harici bir uyarıcı olarak çalışırken, hücresel ve biyomedikal deneylerinde tekrarlanabilirliği artırmak isteyen saha dışı kişiler için özellikle yararlıdır. Nihai amacımız, bu düşük çözünürlüklü tekniklerin gücünü, peptidlerin ve proteinlerin kendi kendine bir araya getirilmesi konusundaki anlayışımızı geliştirmek ve bu temel bilgiyi biyomedikal araştırmalarda veya gıda uygulamalarında çevirmektir.

İlgili konular