SCIENTIFIC HUB

Araştırmanın izini sürün.

SCIENTIFIC LITERATURE · MED

Mitofaji ile İlgili Protein PINK1'in İmmünolojik ve Prognostik Rol için Biyobelirteç Olarak Pan-Kanser Analizi.

Pan-Cancer Analysis of the Mitophagy-Related Protein PINK1 as a Biomarker for the Immunological and Prognostic Role.

Makine çevirisi · Editoryal inceleme bekliyor

Front Oncol · 2020-11-10

DOI: 10.3389/fonc.2020.569887PMID: 33244455

Open accessresearch-article; Journal ArticleKaynağa git ↗

Araştırma özeti

Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by

PINK1 geni mitokondriye lokalize olan ve genellikle hücreleri stres kaynaklı mitokondriyal disfonksiyondan koruyan bir serin / treonin protein kinaz kodlar. PINK1 mutasyonlarının otozomal resesif Parkinson hastalığına yol açtığı gözlemlenmiştir. Bununla birlikte, PINK1'in kanserler arasındaki immünolojik ve prognostik rolleri belirsizliğini korumaktadır.Materyal ve yöntemMevcut çalışmada, PINK1 ekspresyon dağılımını ve kanserler arasındaki immünolojik ve prognostik rolünü araştırmak için Oncomine, PrognoScan, Kaplan-Meier Plotter, GEPIA, TIMER ve cBioportal dahil olmak üzere birden fazla veri tabanı kullandık.Sonuçlar ve tartışmaPINK1, mRNA ekspresyonlarında en çok immünolojik ve prognostikal olarak ortaya çıktı. Kanserler arasında PINK1 ekspresyonunun önemli bir prognostik değeri olmasına rağmen, PINK1 farklı kanser türlerinde koruyucu veya zararlı bir rol oynamıştır. Karaciğer hepatoselüler karsinom ve akciğer skuamöz hücreli karsinom, daha fazla keşif için temsili kanser türleri olarak seçildi. PINK1'in her zaman karaciğer hepatoselüler karsinoma hastalarında klinikopatik özelliklerin tabakalaşmış prognostik analizlerinde koruyucu bir rol oynadığını bulduk. Karaciğer hepatoselüler karsinom ve akciğer skuamöz hücreli karsinom arasında bağışıklık infiltrasyonu ile PINK1 ekspresyonunun korelasyonlarında, B hücrelerinin sızması, CD8+ T hücreleri, CD4+ T hücreleri, makrofajlar, nötrofiller ve dendritik hücreler dahil olmak üzere çelişkili sonuçlar vardı. Ayrıca, B hücrelerinin ve CD8 + T hücrelerinin spesifik belirteçleri de farklı PINK1 ile ilişkili bağışıklık sızma kalıpları sergiledi. Buna ek olarak, PINK1 kopya sayısı varyasyonları ve kanserler arasında bağışıklık sızar arasında önemli bir ilişki vardı.BuluşmaMitofaji ile ilişkili protein PINK1 prognoz ve kanserler arasında bağışıklık yanıtı için bir biyobelirteç olarak çalışabilir.

Özgün kaynak özetini okuyun

IntroductionThe PINK1 gene encodes a serine/threonine protein kinase that localizes to mitochondria and has usually been considered to protect cells from stress-induced mitochondrial dysfunction. PINK1 mutations have been observed to lead to autosomal recessive Parkinson's disease. However, the immunological and prognostic roles of PINK1 across cancers remain unclear.Material and methodIn the current study, we used multiple databases, including Oncomine, PrognoScan, Kaplan-Meier Plotter, GEPIA, TIMER, and cBioportal, to investigate the PINK1 expression distribution and its immunological and prognostic role across cancers.Results and discussionBioinformatics data revealed that the mRNA expression of PINK1 was downregulated in most tumors. Although there was a significant prognostic value of PINK1 expression across cancers, PINK1 played a protective or detrimental role in different kinds of cancers. Liver hepatocellular carcinoma and lung squamous cell carcinoma were selected as representative cancer types for further exploration. We found that PINK1 always played a protective role in liver hepatocellular carcinoma patients in the stratified prognostic analyses of clinicopathological characteristics. There were contradictory results between liver hepatocellular carcinoma and lung squamous cell carcinoma in the correlations of PINK1 expression with immune infiltration, including infiltration of B cells, CD8+ T cells, CD4+ T cells, macrophages, neutrophils, and dendritic cells. Furthermore, specific markers of B cells and CD8+ T cells also exhibited different PINK1-related immune infiltration patterns. In addition, there was a significant association between PINK1 copy number variations and immune infiltrates across cancers.ConclusionThe mitophagy-related protein PINK1 can work as a biomarker for prognosis and the immune response across cancers.

Bilimsel değerlendirme

01

Araştırma sorusu

Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.

02

Yöntem ve örneklem

Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.

03

Temel bulgular

Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.

04

Sınırlılıklar

Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.

Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.