Proteomics Analysis of Gastric Cancer Patients with Diabetes Mellitus.

Araştırma özeti

Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by

Proteomik, kanserin moleküler mekanizmalarını incelemek için güçlü bir yaklaşımdır. Bu çalışmada, diabetes mellitus (DM) tip 2 hastalarında mide kanserinin (GC) proteomik profilini karakterize etmeyi amaçlıyoruz. Proteomik analiz için diyabetik hastalardan 19 vaka ve diyabetli olmayan bireylerden 21 vaka (kontrol grubu) dahil olmak üzere kırk GC doku örneği seçildi. Gastrik dokular tek pot, katı faz arttırılmış numune hazırlama yaklaşımı-SP3 ve tripsin ile enzimatik sindirim sonrasında işlenmiştir. Elde edilen peptidler LC-MS Sıvı Kromatografi-Mass Spektrometrisi (LC-MS) ile analiz edildi. Diyabetik ve diyabetik olmayan hastalardan alınan GC örnekleri arasındaki protein ekspresyon seviyelerinin karşılaştırılması, etiketsiz niceleme (LFQ) ile gerçekleştirildi. 40 örneklemde toplam 6599 protein grubu tespit edildi. Bu iki grup arasında otuz yedi protein diferansiyel olarak ifade edildi, diyabetik kohortta 16 upregülasyon ve 21 downregülasyon yapıldı. Gen Ontolojisi (GO), Kyoto Genler ve Genomlar Ansiklopedisi (KEGG), Reactome ve Hastalık fonksiyonel veritabanları da dahil olmak üzere farklı açıklama setleri için istatistiksel aşırı temsil testleri düşünülmüştür. Diyabetik hastalardan alınan GC örneklerinde yer alan üst düzey proteinler özellikle solunum elektronu taşıma ve alkol metabolik biyolojik süreçlerde zenginleştirilirken, alt düzey proteinler epitel kanserleri, bağırsak hastalıkları ve hücre hücresi bağlantı hücresel bileşenleri ile ilişkilendirilmiştir. Birlikte ele alınan bu sonuçlar, diyabeti Alzheimer ve Parkinson gibi metabolik bozukluklar ve diyabetle ilişkili hastalıklarla ilişkilendiren ve aynı zamanda yedi GC ile ilişkili protein hedefi, klaudin-3, polimerik immünoglobulin reseptör proteini, kadherin-17, villin-1, transglutaminaz-2, desmoglein-2 ve daha fazla araştırma yapılmasını sağlayan mucin-13 hakkında değerli bilgiler sağlayan önceki çalışmalar tarafından elde edilen verileri desteklemektedir.

Özgün kaynak özetini okuyun

Proteomics is a powerful approach to study the molecular mechanisms of cancer. In this study, we aim to characterize the proteomic profile of gastric cancer (GC) in patients with diabetes mellitus (DM) type 2. Forty GC tissue samples including 19 cases from diabetic patients and 21 cases from individuals without diabetes (control group) were selected for the proteomics analysis. Gastric tissues were processed following the single-pot, solid-phase-enhanced sample preparation approach-SP3 and enzymatic digestion with trypsin. The resulting peptides were analyzed by LC-MS Liquid Chromatography-Mass Spectrometry (LC-MS). The comparison of protein expression levels between GC samples from diabetic and non-diabetic patients was performed by label-free quantification (LFQ). A total of 6599 protein groups were identified in the 40 samples. Thirty-seven proteins were differentially expressed among the two groups, with 16 upregulated and 21 downregulated in the diabetic cohort. Statistical overrepresentation tests were considered for different annotation sets including the Gene Ontology(GO), Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG), Reactome, and Disease functional databases. Upregulated proteins in the GC samples from diabetic patients were particularly enriched in respiratory electron transport and alcohol metabolic biological processes, while downregulated proteins were associated with epithelial cancers, intestinal diseases, and cell-cell junction cellular components. Taken together, these results support the data already obtained by previous studies that associate diabetes with metabolic disorders and diabetes-associated diseases, such as Alzheimer's and Parkinson's, and also provide valuable insights into seven GC-associated protein targets, claudin-3, polymeric immunoglobulin receptor protein, cadherin-17, villin-1, transglutaminase-2, desmoglein-2, and mucin-13, which warrant further investigation.

Bilimsel değerlendirme

Araştırma sorusu

Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.

Yöntem ve örneklem

Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.

Temel bulgular

Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.

Sınırlılıklar

Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.

Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.