NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Arka planKolon kanseri (CC), en yaygın malign tümörlerden biridir, Parkinson hastalığı (PD) ise ikinci en yaygın nörodejeneratif bozukluktur. Son zamanlarda toplanan kanıtlar, bu iki hastalığın birbirleriyle ilişkili olduğunu göstermektedir. Ayrıca, uzun kodlamayan RNA'ların bakış açısından, H19 ve PVT1 gibi bazı iyi bilinen genler bu iki hastalığı birbirine bağlayabilir. Birkaç çalışma, PD'li hastaların, PD'li olmayan hastalara kıyasla CC geliştirme riskinin azaldığını göstermiştir. Bununla birlikte, PD ve CC arasındaki ilişkiyi çevreleyen tartışmalar ve bugüne kadar, hiçbir konkordant sonuç alınmamıştır.MetodlarBu çalışmada, bu iki hastalık arasındaki ilişkiyi lncRNA-incRNA etkileşimlerine dayanarak değerlendirmeyi amaçladık. Ağırlıklı gen eş-ifade ağ analizi yöntemi ile motive, PD ve CC için ilgili etkileşim ağlarında diferansiyel korelasyonlu kenarları (DCE'ler) tanımlamak ve bu iki hastalığın nasıl bağlantılı olduğunu keşfetmek için özelleştirilmiş bir prosedür önerilmiş ve kullanılmıştır.SonuçlarPD ve CC için DCE'lerin iki seti, 16 çift üst üste bindi. Bunlar arasında, 15 kenarın zıt işaretleri vardı, CC için pozitif işaretler bağlantı kazancını gösterirken, PD için negatif işaretler bağlantı kaybını gösterir.IncRNA ifade profillerini kullanarak ve özelleştirilmiş bir prosedürle, PD ve CC'nin nasıl ilişkili olduğu sorusuna bir cevap verilir.
Özgün kaynak özetini okuyun
BackgroundColon cancer (CC) is one of the most common malignant tumors, while Parkinson's disease (PD) is the second most common neurodegenerative disorder. Recent accumulating evidence indicates that these two diseases are associated with each other. Also, from the perspective of long non-coding RNAs, some well-known genes such as H19 and PVT1 can link these two diseases together. Several studies have shown that patients with PD had a decreased risk of developing CC compared with patients without PD. However, controversies surround the relationship between PD and CC, and to date, no concordant conclusion has been drawn.MethodsIn this study, we aimed to assess the association between these two diseases based on lncRNA-to-lncRNA interactions. Motivated by the weighted gene co-expression network analysis method, a customized procedure was proposed and used to identify differentially correlated edges (DCEs) in the respective interaction networks for PD and CC and explore how these two diseases are linked.ResultsOf the two sets of DCEs for PD and CC, 16 pairs overlapped. Among them, 15 edges had opposite signs, with positive signs for CC indicating a gain of connectivity, whereas negative signs for PD indicating a loss of connectivity.ConclusionsBy using the lncRNA expression profiles, and a customized procedure, an answer to the question about how PD and CC are associated is provided.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.