NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
BackgroundOverexpression NPM1 çeşitli tümör hücrelerinin büyümesini ve çoğalmasını teşvik edebilir. Bununla birlikte, akciğer adenokarsinomunda (LUAD) NPM1'in kapsamlı analizi hakkında çok az çalışma vardır. LUAD ve klinikopatolojik analizde NPM1'in ekspresyonunu analiz etmek için MethodsTCGA ve GEO veri setleri kullanılmıştır. NPM1 co-expression ve gen seti zenginleştirme analizinin (GSEA) GO/KEGG zenginleştirme analizi R yazılım paketi kullanılarak gerçekleştirildi. NPM1 ekspresyonu ile LUAD bağışıklık infiltrasyonu arasındaki ilişki TIMER, GEPIA veritabanı ve TCGA veri setleri kullanılarak analiz edildi ve NPM1 ekspresyon seviyesi ile LUAD m6A modifikasyonu ve glikoliz arasındaki ilişki TCGA ve GEO veri setleri kullanılarak analiz edildi.ResultsNPM1, LUAD dahil olmak üzere çeşitli tümörlerde aşırı eksprese edildi ve ROC eğrisi, NPM1'in normal tümörleri tahmin etmede belirli bir doğruluğu olduğunu gösterdi. LUAD'da NPM1'in ekspresyon seviyesi tümör evresi ve prognoz ile önemli ölçüde ilişkilidir. GO/KEGG zenginleştirme analizi, NPM1'in çevirisel inisiyasyon, ribozom, ribozom, Parkinson hastalığı ve RNA taşımanın yapısal bileşeni ile yakından ilişkili olduğunu göstermiştir. GSEA, NPM1 ile ilişkili diferansiyel genlerin ana zenginleştirme yolunun esas olarak mTORC1 aracılı sinyalleme, p53 hipoksi yolu, EGFR tarafından kanserde sinyal verme, antijenin ikinci habercilerin nesline yol açan B hücre reseptörü BCR'yi aktive ettiğini gösterdi, aerobik glikoliz ve metilasyon yolları. TIMER, GEPIA veritabanı ve TCGA veri setlerinin analizi, NPM1'in ifade seviyesinin B hücreleri ve NK hücreleri ile negatif olarak ilişkili olduğunu göstermiştir. TCGA ve GEO veri setleri analizi, NPM1 ifadesinin bir m6A değiştirici ilişkili gen (YTHDF2) ve beş glikoliz ile ilişkili gen (ENO1, HK2, LDHA, LDHB ve SLC2A1) ile anlamlı bir şekilde ilişkili olduğunu göstermiştir.ConclusionNPM1, LUAD'ın bağışıklık infiltrasyonuna katılan ve m6A modifikasyonu ve glikoliz ile ilişkili bir prognostik biyobeldir. NPM1, LUAD'ın teşhisi ve tedavisi için etkili bir hedef olarak kullanılabilir.
Özgün kaynak özetini okuyun
BackgroundOverexpression of NPM1 can promote the growth and proliferation of various tumor cells. However, there are few studies on the comprehensive analysis of NPM1 in lung adenocarcinoma (LUAD).MethodsTCGA and GEO data sets were used to analyze the expression of NPM1 in LUAD and clinicopathological analysis. The GO/KEGG enrichment analysis of NPM1 co-expression and gene set enrichment analysis (GSEA) were performed using R software package. The relationship between NPM1 expression and LUAD immune infiltration was analyzed using TIMER, GEPIA database and TCGA data sets, and the relationship between NPM1 expression level and LUAD m6A modification and glycolysis was analyzed using TCGA and GEO data sets.ResultsNPM1 was overexpressed in a variety of tumors including LUAD, and the ROC curve showed that NPM1 had a certain accuracy in predicting the outcome of tumors and normal samples. The expression level of NPM1 in LUAD is significantly related to tumor stage and prognosis. The GO/KEGG enrichment analysis indicated that NPM1 was closely related to translational initiation, ribosome, structural constituent of ribosome, ribosome, Parkinson disease, and RNA transport. GSEA showed that the main enrichment pathway of NPM1-related differential genes was mainly related to mTORC1 mediated signaling, p53 hypoxia pathway, signaling by EGFR in cancer, antigen activates B cell receptor BCR leading to generation of second messengers, aerobic glycolysis and methylation pathways. The analysis of TIMER, GEPIA database and TCGA data sets showed that the expression level of NPM1 was negatively correlated with B cells and NK cells. The TCGA and GEO data sets analysis indicated that the NPM1 expression was significantly correlated with one m6A modifier related gene (YTHDF2) and five glycolysis related genes (ENO1, HK2, LDHA, LDHB and SLC2A1).ConclusionNPM1 is a prognostic biomarker involved in immune infiltration of LUAD and associated with m6A modification and glycolysis. NPM1 can be used as an effective target for diagnosis and treatment of LUAD.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.