NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Arka planParkinson hastalığı (PD), orta yaşlı ve yaşlı insanlarda yaygın bir nörodejeneratif hastalıktır. Liuwei Dihuang (LWDH) hapları PD üzerinde iyi bir etkiye sahiptir, ancak mekanizması belirsizliğini korumaktadır. Ağ farmakolojisi, hastalık ağlarına ilaç müdahalesi mekanizmasını sistematik ve kapsamlı bir şekilde yansıtabilen temel tıp, biyoloji, bilgisayar bilimi, biyoinformatik ve diğer disiplinlerin temel teorilerini ve araştırma yöntemlerini entegre etmenin sonucudur.LWDH haplarındaki bitkilerin ana bileşenleri ve hedefleri Geleneksel Çin Tıp Sistemleri Farmakoloji Veritabanı ve Analiz Platformu (TCMSP) aracılığıyla elde edilmiştir. Aktif bileşenleri absorpsiyon, dağıtım, metabolizma ve atılım (ADME) esas alınarak tarandı; PD ile ilgili hedefler Genecards, OMIM, TTD ve DRUGBANK veri tabanlarından elde edildi. R'yi LWDH ve PD ile ilgili hedeflerin kesişme noktasını ve Cytoscape yazılımını ilaç bileşeni hedef ağını oluşturmak için kullandık. Dahası, STRING ve Cytoscape yazılımı, protein-protein etkileşimlerini (PPI) analiz etmek, bir PPI ağı oluşturmak ve ağdaki potansiyel protein fonksiyonel modüllerini keşfetmek için kullanıldı. Metascape platformu KEGG yolu ve GO fonksiyonu zenginleştirme analizlerini gerçekleştirmek için kullanıldı. Son olarak, bileşiğin ve hedefin iyi bir bağlanma aktivitesine sahip olup olmadığını doğrulamak için moleküler kenetlenme gerçekleştirildi.Sonuçlar Tarama ve dedükplikasyondan sonra 210 etkili aktif bileşen, 204 ilaç hedefi, 4333 hastalık hedefi ve 162 ilaç-hastalık hedefi elde edildi. Sonuç olarak bir ilaç bileşeni-hedef ağı ve bir PPI-ilaç-hastalık-hedef ağı kurduk. Sonuçlar, LWDH haplarının hub bileşenlerinin quercetin, stigmasterol, kaempferol ve beta-sitosterol olduğunu gösterdi; hub hedefleri AKT1, VEGFA ve IL6 idi. GO ve KEGG zenginleştirme analizleri, bu hedeflerin nöronal ölüm, G proteini ile eşleştirilmiş amin reseptörü aktivitesi, reaktif oksijen türleri metabolik süreçler, membran salları, MAPK sinyal yolları, hücresel senans ve diğer biyolojik süreçlerde yer aldığını göstermiştir. Moleküler kenetlenme, hub bileşenlerinin hub hedefleri ile iyi bir anlaşma içinde olduğunu gösterdi.ConclusionLWDH hapları, birkaç aktif bileşen içerdiğinden, çoklu ligandları hedeflediklerinden ve çeşitli yolları etkinleştirdiklerinden PD tedavisi için etkileri vardır. Hub bileşenleri muhtemelen quercetin, stigmasterol, kaempferol ve beta-sitosterol içerir ve nöronal ölümü, G proteini ile birleştirilmiş amin reseptörü aktivitesini, reaktif oksijen türlerini metabolik süreci, membran salı, MAPK sinyal yolu ve PD tedavisi için hücresel senescence'i düzenlemek için AKT1, VEGFA ve IL6 gibi hub hedefleri ile eşleme yoluyla hareket eder.
Özgün kaynak özetini okuyun
BackgroundParkinson's disease (PD) is a common neurodegenerative disease in middle-aged and elderly people. Liuwei Dihuang (LWDH) pills have a good effect on PD, but its mechanism remains unclear. Network pharmacology is the result of integrating basic theories and research methods of medicine, biology, computer science, bioinformatics, and other disciplines, which can systematically and comprehensively reflect the mechanism of drug intervention in disease networks.MethodsThe main components and targets of herbs in LWDH pills were obtained through Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform (TCMSP). Its active components were screened based on absorption, distribution, metabolism, and excretion (ADME); the PD-related targets were obtained from the Genecards, OMIM, TTD, and DRUGBANK databases. We used R to take the intersection of LWDH- and PD-related targets and Cytoscape software to construct the drug-component-target network. Moreover, STRING and Cytoscape software was used to analyze protein-protein interactions (PPI), construct a PPI network, and explore potential protein functional modules in the network. The Metascape platform was used to perform KEGG pathway and GO function enrichment analyses. Finally, molecular docking was performed to verify whether the compound and target have good binding activity.ResultsAfter screening and deduplication, 210 effective active ingredients, 204 drug targets, 4333 disease targets, and 162 drug-disease targets were obtained. We consequently constructed a drug-component-targets network and a PPI-drug-disease-targets network. The results showed that the hub components of LWDH pills were quercetin, stigmasterol, kaempferol, and beta-sitosterol; the hub targets were AKT1, VEGFA, and IL6. GO and KEGG enrichment analyses showed that these targets are involved in neuronal death, G protein-coupled amine receptor activity, reactive oxygen species metabolic processes, membrane rafts, MAPK signaling pathways, cellular senescence, and other biological processes. Molecular docking showed that the hub components were in good agreement with the hub targets.ConclusionLWDH pills have implications for the treatment of PD since they contain several active components, target multiple ligands, and activate various pathways. The hub components possibly include quercetin, stigmasterol, kaempferol, and beta-sitosterol and act through pairing with hub targets, such as AKT1, VEGFA, and IL6, to regulate neuronal death, G protein-coupled amine receptor activity, reactive oxygen species metabolic process, membrane raft, MAPK signaling pathway, and cellular senescence for the treatment of PD.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.