Changes in the Gut Microbiome and Predicted Functional Metabolic Effects in an Australian Parkinson's Disease Cohort.

Araştırma özeti

Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by

Arka plan: Parkinson hastalığında (PD) bağırsak mikrobiyomunun öneminin giderek daha fazla tanınması olmuştur, ancak coğrafi konumun etkisi çok az ilgi görmüştür. Bu çalışma, Avustralya'da PD (PwP) olan bir grup insanda bağırsak mikrobiyotasını ve konak metabolik yollarındaki ilişkili değişiklikleri karakterize etti. Yöntemler: Çalışma, Avustralya'daki çoklu Hareket Bozuklukları Kliniklerinden 87 PwP'nin işe alınmasını ve değerlendirilmesini ve 47 sağlıklı kontrolleri içeriyordu. 16S rRNA geninin V3 ve V4 bölgelerinin Illumina dizilimi, bağırsak mikrobiyotasındaki kohortlar arası farklılıkları ayırt etmek için kullanıldı; KEGG analizi daha sonra konak metabolik yollarındaki fonksiyonel değişiklikleri tahmin etmek için yapıldı. Bulgular: Mevcut bulgular, mikrobiyal operasyonel taksonomik birimlerin (OTU'lar) ve PwP ile kontrol grupları arasındaki spesifik bakteriyel taksonominin göreceli bolluğu ve çeşitliliğinde önemli farklılıklar tespit etti. Alfa çeşitliliği PwP'de kontrollere kıyasla önemli ölçüde azalmıştır. Farklar iki filoda (Synergistetes ve Proteobacteria; her ikisi de PwP'de arttı) ve beş cinste (Colidextribacter, Intestinibacter, Kineothrix, Agathobaculum ve Roseburia; hepsi PwP'de azaldı) bulundu. PD kohortu içinde, mikrobiyal bileşim ile cinsiyet, kabızlık veya gastrointestinal ilaç kullanımı arasında bir ilişki saptanmadı. Ayrıca, KEGG analizi PwP'de önemli ölçüde değiştirileceği tahmin edilen 15 adet upregüle ve 11 adet düşük regüle metabolik yol tespit etti. Sonuç: Bu çalışma, güney yarımküre PD popülasyonunda bağırsak mikrobiyomunun ilk kapsamlı karakterizasyonunu ve fonksiyonel metabolik etkilerini öngörerek, bağırsak mikrobiyotasının bu hastalık üzerinde etkisini gösterebileceği olası mekanizmaları daha da araştırarak ve bu tür verilerin gelecekteki bireyselleştirilmiş terapötik stratejilere dahil edilmesi için kanıt sağlar.

Özgün kaynak özetini okuyun

Background: There has been increasing recognition of the importance of the gut microbiome in Parkinson's disease (PD), but the influence of geographic location has received little attention. The present study characterized the gut microbiota and associated changes in host metabolic pathways in an Australian cohort of people with PD (PwP). Methods: The study involved recruitment and assessment of 87 PwP from multiple Movement Disorders Clinics in Australia and 47 healthy controls. Illumina sequencing of the V3 and V4 regions of the 16S rRNA gene was used to distinguish inter-cohort differences in gut microbiota; KEGG analysis was subsequently performed to predict functional changes in host metabolic pathways. Results: The current findings identified significant differences in relative abundance and diversity of microbial operational taxonomic units (OTUs), and specific bacterial taxa between PwP and control groups. Alpha diversity was significantly reduced in PwP when compared to controls. Differences were found in two phyla (Synergistetes and Proteobacteria; both increased in PwP), and five genera (Colidextribacter, Intestinibacter, Kineothrix, Agathobaculum, and Roseburia; all decreased in PwP). Within the PD cohort, there was no association identified between microbial composition and gender, constipation or use of gastrointestinal medication. Furthermore, KEGG analysis identified 15 upregulated and 11 downregulated metabolic pathways which were predicted to be significantly altered in PwP. Conclusion: This study provides the first comprehensive characterization of the gut microbiome and predicted functional metabolic effects in a southern hemisphere PD population, further exploring the possible mechanisms whereby the gut microbiota may exert their influence on this disease, and providing evidence for the incorporation of such data in future individualized therapeutic strategies.

Bilimsel değerlendirme

Araştırma sorusu

Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.

Yöntem ve örneklem

Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.

Temel bulgular

Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.

Sınırlılıklar

Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.

Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.