NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Çalışmamızın amacı, parkinson bozukluklarının ayrımcılığı için potansiyel tanısal biyobelirteçler olarak beyin omurilik sıvısı (CSF) triptik peptid profillerini araştırmaktı. CSF örnekleri parkinsonizmli bireylerden toplanmıştır, bu kişiler inkluzyon sırasında belirsiz bir tanıya sahipti ve uzunlamasına bir çalışmada 12 yıla kadar takip edildiler. Parkinson hastalığının (PD, n = 10), çoklu sistem atrofisi hastalarında (MSA, n = 5) ve nörolojik olmayan kontrollerde (n = 10) triptik peptidleri tanımlamak için av tüfeği proteomikleri yaptık. PD ve MSA arasında diferansiyel seviyelere sahip triptik peptidleri, PD (n = 46), atipik parkinsonizm hastalarında (AP; MSA, n = 17; Progresif supranükleer palsi; n = 8) ve nörolojik olmayan kontrollerde (n = 39) yeni geliştirilmiş bir reaksiyon izleme (SRM) testi kullanarak doğruladık. PD ve MSA arasında önemli ölçüde farklılık gösteren 191 triptik peptid tespit ettik, bunlardan 34'ü SRM geliştirme kriterlerimizi karşıladı. 14/34 peptid için PD ve AP arasındaki farkları doğruladık. Bu triptik peptidler orta-yüksek doğrulukla AP'den PD'ye ayrımcılık yaptı. Tryptic peptidler artı klinik değerlendirmeler veya diğer CSF parametreleri (nörofilament ışık zinciri, fosforile tau proteini) ve yaş dahil rastgele orman modellemesi, PD'nin ayrımcılığını geliştirdi. AP. Sonuçlarımız, hedefli proteomikler tarafından hedefsiz ve daha sonraki doğrulamalarla triptik peptidlerin keşfedilmesinin, PD ve AP için potansiyel CSF biyobelirteçlerini tanımlamak için uygun bir strateji olduğunu göstermektedir. Ayrıca, diferansiyel biyobelirteçler olarak tanımladığımız triptik peptidler ve buna karşılık gelen proteinler, parkinsonizmin hastalığa özgü patofizyolojik mekanizmaları hakkında mevcut bilgimizi artırabilir.
Özgün kaynak özetini okuyun
The aim of our study was to investigate cerebrospinal fluid (CSF) tryptic peptide profiles as potential diagnostic biomarkers for the discrimination of parkinsonian disorders. CSF samples were collected from individuals with parkinsonism, who had an uncertain diagnosis at the time of inclusion and who were followed for up to 12 years in a longitudinal study. We performed shotgun proteomics to identify tryptic peptides in CSF of Parkinson's disease (PD, n = 10), multiple system atrophy patients (MSA, n = 5) and non-neurological controls (n = 10). We validated tryptic peptides with differential levels between PD and MSA using a newly developed selected reaction monitoring (SRM) assay in CSF of PD (n = 46), atypical parkinsonism patients (AP; MSA, n = 17; Progressive supranuclear palsy; n = 8) and non-neurological controls (n = 39). We identified 191 tryptic peptides that differed significantly between PD and MSA, of which 34 met our criteria for SRM development. For 14/34 peptides we confirmed differences between PD and AP. These tryptic peptides discriminated PD from AP with moderate-to-high accuracy. Random forest modelling including tryptic peptides plus either clinical assessments or other CSF parameters (neurofilament light chain, phosphorylated tau protein) and age improved the discrimination of PD vs. AP. Our results show that the discovery of tryptic peptides by untargeted and subsequent validation by targeted proteomics is a suitable strategy to identify potential CSF biomarkers for PD versus AP. Furthermore, the tryptic peptides, and corresponding proteins, that we identified as differential biomarkers may increase our current knowledge about the disease-specific pathophysiological mechanisms of parkinsonism.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.