NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Tüberküloz (TB), tek bir bulaşıcı ajandan kaynaklanan önde gelen ölüm nedenidir. 2019 yılında tahmin edilen toplam küresel TB ölümleri 1,4 milyondu. TB insidansı oranındaki düşüş çok yavaşken, TB hastalığının önlenmesi ve tedavisinin büyük bir yük olarak kaldığı düşük ve orta gelirli ülkelerde bulaşıcı olmayan hastalıkların (NCD'lerin) yükü katlanarak artmaktadır ve TB ve NCD'ler arasındaki sinerjik etkileşime daha fazla araştırma vurgusunu haklı çıkaracak yeterli ampirik kanıt (bilimsel kanıt) bulunmaktadır. Mevcut çalışmanın, Parkinson hastalığı, kardiyovasküler hastalık, diabetes mellitus, romatoid artrit ve akciğer kanseri gibi NCD'lerle TB'nin üst üste bindirilmesine dayanan bir hastalık-gen ağı (üst üste bindirme, TB ve diğer / s NCD'lerde yer alan genler anlamına gelir) oluşturması önerildi. TB ile ilişkili genleri, gen-hastalık ilişkisini belirlemek için üst üste binen NCD'lerinin genleriyle karşılaştırdık. Daha sonra, insanlarda kürlenmiş ve deneysel olarak doğrulanmış etkileşimleri entegre ederek hastalık genlerinin gen etkileşim ağını kurduk ve ağdaki 13 yüksek kümelenmiş modülü bulduk, bunlar TB ve üst üste binen NCD'lerle ilişkili toplam 86 hub genini içerir, bunlar büyük ölçüde iltihaplanma yanıtı, sitokin uyaranına hücresel yanıt, sitokin, sitokin aracılı sinyalleme sistemine yanıt, strese karşı tepki, savunma. Dahası, tanımlanmış hub genleri ve ilgili ilaçları, uyuşturucu-hedef etkileşiminin çözülmesine yardımcı olan, bu ilaçların görünüşte ilgisiz hedefler ve yollar üzerindeki etkili rollerini vurgulayan iki parçalı bir ağ oluşturmak için istismar edildi. Bu hub proteinlerini ilaç kombinasyonu veya ilaç repurposing yaklaşımları kullanarak hedeflemek, komorbiditedeki klinik koşulları iyileştirecek, birkaç ilacın potensisini artıracak ve daha iyi sonuçlarla sinerjik bir etki verecektir. Bu nedenle, Mycobacterium tuberculosis (Mtb) enfeksiyonunu ve ilişkili NCD'leri anlamak, insan sağlığı üzerindeki kısa ve uzun vadeli etkilerini içermek için yüksek bir önceliktir. Ağ tabanlı analizimiz, daha kişiselleştirilmiş tedavi, ilaç-repurposing fırsatları için yeni bir ufuk açıyor, yeni hedefleri araştırıyor, çok ilaç tedavisi yapıyor ve ilgisiz ilaçların TB ve üst üste binen NCD'leri için çeşitli yan etkilerini ortaya çıkarabilir.
Özgün kaynak özetini okuyun
Tuberculosis (TB) is the leading cause of death from a single infectious agent. The estimated total global TB deaths in 2019 were 1.4 million. The decline in TB incidence rate is very slow, while the burden of noncommunicable diseases (NCDs) is exponentially increasing in low- and middle-income countries, where the prevention and treatment of TB disease remains a great burden, and there is enough empirical evidence (scientific evidence) to justify a greater research emphasis on the syndemic interaction between TB and NCDs. The current study was proposed to build a disease-gene network based on overlapping TB with NCDs (overlapping means genes involved in TB and other/s NCDs), such as Parkinson's disease, cardiovascular disease, diabetes mellitus, rheumatoid arthritis, and lung cancer. We compared the TB-associated genes with genes of its overlapping NCDs to determine the gene-disease relationship. Next, we constructed the gene interaction network of disease-genes by integrating curated and experimentally validated interactions in humans and find the 13 highly clustered modules in the network, which contains a total of 86 hub genes that are commonly associated with TB and its overlapping NCDs, which are largely involved in the Inflammatory response, cellular response to cytokine stimulus, response to cytokine, cytokine-mediated signaling pathway, defense response, response to stress and immune system process. Moreover, the identified hub genes and their respective drugs were exploited to build a bipartite network that assists in deciphering the drug-target interaction, highlighting the influential roles of these drugs on apparently unrelated targets and pathways. Targeting these hub proteins by using drugs combination or drug repurposing approaches will improve the clinical conditions in comorbidity, enhance the potency of a few drugs, and give a synergistic effect with better outcomes. Thus, understanding the Mycobacterium tuberculosis (Mtb) infection and associated NCDs is a high priority to contain its short and long-term effects on human health. Our network-based analysis opens a new horizon for more personalized treatment, drug-repurposing opportunities, investigates new targets, multidrug treatment, and can uncover several side effects of unrelated drugs for TB and its overlapping NCDs.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.