SCIENTIFIC HUB

Araştırmanın izini sürün.

SCIENTIFIC LITERATURE · MED

Kantitatif Proteomikler Tip60 tarafından Aracılık Edilen Lysine 2-Hidroksiizobütirilasyon Pathway'in Rolünü Ortaya Çıkarır.

Quantitative Proteomics Reveals the Role of Lysine 2-Hydroxyisobutyrylation Pathway Mediated by Tip60.

Makine çevirisi · Editoryal inceleme bekliyor

Oxid Med Cell Longev · 2022-02-08

DOI: 10.1155/2022/4571319PMID: 35178156

Open accessresearch-article; Journal ArticleKaynağa git ↗

Araştırma özeti

Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by

Lisin 2-hidroksiizobütirilasyon (Khib), ökaryotik hücre histonlarında kapsamlı olarak bildirilen yeni bir posttranslasyonel modifikasyon türüdür. Evrimsel olarak korunur ve transkripsiyon ve hücre metabolizması gibi çeşitli önemli biyolojik süreçlere katılır. Son zamanlarda, Khib'in p300 ve Tip60 tarafından düzenlenebildiği gösterilmiştir. P300 tarafından aracılık edilen spesifik Khib substratları ortaya çıkmış olsa da, Tip60'ın Khib yolu aracılığıyla çeşitli hücresel süreçleri nasıl düzenlediği ve Tip60 ile p300 arasındaki farklı rollerin Khib'i düzenlemede büyük ölçüde bilinmeyen kalması, bu modifikasyonun biyolojik işlevlerini nasıl yerine getirdiğini anlamamızı engelliyor. Bu çalışmada Tip60 tarafından aracılık edilen ilk Khib proteomunu rapor ediyoruz. Toplamda, 1050 proteinden 3502 benzersiz Khib bölgesi tespit edildi. Bunlar arasında, 406 proteinden 536 Khib bölgesi yalnızca Tip60 aşırı ekspresyon hücrelerinde mevcuttu ve 13 Khib bölgesi Tip60 aşırı ekspresyonuna yanıt olarak 2 kattan fazla arttı, Tip60'ın küresel Khib'i önemli ölçüde etkilediğini gösterdi. Özellikle, 549 Tip60 hedefli Khib sitelerinden sadece 5'i, p300 tarafından hedeflenen 149 bilinen Khib sitesi ile örtüşerek Tip60 ve p300'ün farklı Khib substrat tercihlerini gösterir. Buna ek olarak, Tip60 tarafından düzenlenen Khib substratları, nükleik asit metabolizması ve çevirisi gibi süreçlerde derinden yer alır ve bazıları Parkinson ve Prion hastalıkları ile ilişkilidir. Özetle, araştırmamız Tip60 tarafından hedeflenen ve Tip60'ın çeşitli hücresel süreçlerin Khib yolu üzerinden düzenlenmesindeki etkisini açıklayan ve Tip60'ın fonksiyonel mekanizmasına yeni görüşler öneren Khib substratlarını ortaya koyuyor.

Özgün kaynak özetini okuyun

Lysine 2-hydroxyisobutyrylation (Khib) is a new type of posttranslational modifications (PTMs) extensively reported on eukaryotic cell histones. It is evolutionarily conserved and participates in diverse important biological processes, such as transcription and cell metabolism. Recently, it has been demonstrated that Khib can be regulated by p300 and Tip60. Although the specific Khib substrates mediated by p300 have been revealed, how Tip60 regulates diverse cellular processes through the Khib pathway and the different roles between Tip60 and p300 in regulating Khib remain largely unknown, which prevents us from understanding how this modification executes its biological functions. In this study, we report the first Khib proteome mediated by Tip60. In total, 3502 unique Khib sites from 1050 proteins were identified. Among them, 536 Khib sites from 406 proteins were present only in Tip60 overexpressing cells and 13 Khib sites increased more than 2-fold in response to Tip60 overexpression, indicating that Tip60 significantly affected global Khib. Notably, only 5 of the 549 Tip60-targeted Khib sites overlapped with the 149 known Khib sites targeted by p300, indicating the different Khib substrate preferences of Tip60 and p300. In addition, the Khib substrates regulated by Tip60 are deeply involved in processes such as nucleic acid metabolism and translation, and some are associated with Parkinson's and Prion diseases. In summary, our research reveals the Khib substrates targeted by Tip60, which elucidates the effect of Tip60 in regulating various cellular processes through the Khib pathway, and proposes novel views into the functional mechanism of Tip60.

Bilimsel değerlendirme

01

Araştırma sorusu

Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.

02

Yöntem ve örneklem

Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.

03

Temel bulgular

Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.

04

Sınırlılıklar

Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.

Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.