NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
BackgroundMikrobiyom'un bazı kanserlere önemli ölçüde katkıda bulunduğu gösterilmiştir. Bununla birlikte, kafa ve boyun skuamöz hücre karsinomunda (HNSCC) mikrobiyomun tanısal etkileri bilinmemektedir.Metodlar Oral ve oral olmayan HNSCC'nin mikrobiyomundaki moleküler farkı belirlemek için, birincil veriler Kraken-TCGA veri kümesinden indirildi. Oral ve oral olmayan HNSCC'nin mikrobiyomlarındaki moleküler farklılıklar, doğrusal diskriminant analiz etki boyutu yöntemi kullanılarak tanımlanmıştır.SonuçlarÇalışmada, oral ve oral olmayan kanserlerde yaygın mikrobiyomlar sırasıyla Fusobacterium, Leptotrichia, Selenomonas ve Treponema ve Clostridium ve Pseudoalteromonas idi. Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) yolları ile oral kanserde pozitif ve negatif olarak ilişkili olan eşsiz mikrobiyal imzalar bulduk. Oral kanserde, pozitif korelasyona sahip genler çoğunlukla prion hastalıkları, Alzheimer hastalığı, Parkinson hastalığı, Salmonella enfeksiyonu ve Patojenik Escherichia coli enfeksiyonunda bulunmuştur. Oral olmayan kanserde, pozitif korelasyona sahip genler Herpes simpleks virüsü 1 enfeksiyonu ve Spliceozom ve negatif korelasyona sahip genlerin PI3K-Akt sinyalleme yolu, Odak yapışması, aktin sitoskeleton düzenlenmesi, ECM-reseptör etkileşimi ve Dilated kardiyomiyopatiden elde edilen sonuçları gösterdi.Bu sonuçlar, oral ve non-oral HCC'nin mikrobiyomunun altında yatan biyolojik mekanizmaların anlaşılmasına yardımcı olabilir. Mikrobiyom tabanlı onkoloji tanı aracı daha fazla keşif yapılmasını garanti eder.
Özgün kaynak özetini okuyun
BackgroundMicrobiome has been shown to substantially contribute to some cancers. However, the diagnostic implications of microbiome in head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) remain unknown.MethodsTo identify the molecular difference in the microbiome of oral and non-oral HNSCC, primary data was downloaded from the Kraken-TCGA dataset. The molecular differences in the microbiome of oral and non-oral HNSCC were identified using the linear discriminant analysis effect size method.ResultsIn the study, the common microbiomes in oral and non-oral cancers were Fusobacterium, Leptotrichia, Selenomonas and Treponema and Clostridium and Pseudoalteromonas, respectively. We found unique microbial signatures that positively correlated with Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathways in oral cancer and positively and negatively correlated KEGG pathways in non-oral cancer. In oral cancer, positively correlated genes were mostly found in prion diseases, Alzheimer disease, Parkinson disease, Salmonella infection, and Pathogenic Escherichia coli infection. In non-oral cancer, positively correlated genes showed Herpes simplex virus 1 infection and Spliceosome and negatively correlated genes showed results from PI3K-Akt signaling pathway, Focal adhesion, Regulation of actin cytoskeleton, ECM-receptor interaction and Dilated cardiomyopathy.ConclusionsThese results could help in understanding the underlying biological mechanisms of the microbiome of oral and non-oral HNSCC. Microbiome-based oncology diagnostic tool warrants further exploration.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.