NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
SNCA geni Parkinson hastalığı (PD) patolojisinde kritik bir gendir. Kanıtları bir araya getirmek, SNCA'nın tümörigenezi ile ilgili olduğunu gösterir; Bununla birlikte, akciğer adenokarsinomunda (LUAD) SNCA'nın rolü belirsizliğini korumaktadır. Bu çalışma, SNCA'nın potansiyel değerini LUAD'da prognostik ve tanısal bir moleküler belirteç olarak keşfetmeyi amaçladı.MetodlarBu çalışmada, Oncomine, UALCAN ve Kaplan-Meier Plotter'e dayanan LUAD'da SNCA'nın ekspresyon desenini, prognostik değerini ve promoter metilasyon durumunu araştırdık. Daha sonra, TIMER kullanarak, SNCA ekspresyonu ve bağışıklık sızması arasındaki korelasyonu araştırdık. Ve cBioPortal, SNCA ekspresyonu ve bağışıklık kontrol noktası arasındaki korelasyonu analiz etmek için kullanıldı. SNCA'yı aşırı ifade eden A549 hücrelerinin transkriptom verileri, SNCA'nın LUAD'daki potansiyel bağışıklık rolünü daha fazla incelemek için kullanıldı. SNCA'nın A549 hücrelerinin proliferasyonu üzerindeki etkisi CCK-8, EDU ve koloni oluşumu tarafından değerlendirildi. Son olarak, 5-aza-dC ile tedavi edilen LUAD hücre çizgileri, artmış promotör metilasyonu ile SNCA'nın düşük regüle edilmiş mRNA ekspresyonu arasındaki korelasyonu araştırmak için kullanılmıştır.SonuçlarGenel olarak, LUAD dokusundaki SNCA'nın ekspresyon seviyesi normal dokudakinden daha düşüktü ve SNCA'nın yüksek ekspresyonu daha iyi prognozla ilişkiliydi. SNCA ekspresyonu ve bağışıklık sızmaları arasında CD8+ T hücreleri, makrofajlar, nötrofiller, dendritik hücreler, B hücreleri ve CD4+ T hücreleri ile bağışıklık kontrol noktaları arasında anlamlı pozitif korelasyonlar vardı ve bu da bağışıklık sızmasının SNCA'nın LUAD'daki prognoz üzerindeki etkisinden biri olduğunu düşündürdü. SNCA'yı aşırı ifade eden A549 hücrelerinin transkriptom verileri, SNCA tarafından düzenlenen ilgili bağışıklıkla ilgili genleri taramak için daha fazla kullanıldı. Zenginleştirme analizi, SNCA'nın PI3K-AKT sinyalleme yoluna ve diğer önemli tümör sinyal yollarına katıldığını ve MAPK3, SRC, PLCG1 ve SHC1 ifadesini düzenlediğini doğruladı. Hücresel proliferasyon tahlili, SNCA'nın PI3K / AKT / mTOR yolunun inhibe edici aktivitesi yoluyla A549 hücrelerinin büyümesini yaşayabileceğini gösterdi. Son olarak, SNCA promotörünün metilasyon seviyesinin analizi, promotör metilasyonun mRNA düzeyi ile negatif korelasyon gösterdiğini göstermiştir. LUAD hücre hatlarında SNCA'nın ifadesi 5-aza-dC ile tedavi ile önemli ölçüde yükseltilmiştir. LUAD'da SNCA promotörünün yüksek metilasyonu, SNCA mRNA seviyesinin düşürülmesinin nedenlerinden biridir. SNCA'nın A549 hücrelerinin çoğalmasını engelleyebileceği ve bağışıklık sızmalarıyla ilişkili olduğu göz önüne alındığında, LUAD'da prognostik bir biyobelirteç olarak görev yapabilir.
Özgün kaynak özetini okuyun
BackgroundThe SNCA gene is a critical gene in Parkinson's disease (PD) pathology. Accumulating evidence indicates that SNCA is involved in tumorigenesis; however, the role of SNCA in lung adenocarcinoma (LUAD) remains unclear. This study aimed to explore the potential value of SNCA as a prognostic and diagnostic molecular marker in LUAD.MethodsIn this study, we explored the expression pattern, prognostic value, and promoter methylation status of SNCA in LUAD based on Oncomine, UALCAN, and Kaplan-Meier Plotter. Then, using TIMER, we investigated the correlation between SNCA expression and immune infiltration. And cBioPortal were used to analysis the correlation between SNCA expression and immune checkpoint. The transcriptome data of A549 cells overexpressing SNCA were used to further study the potential immune role of SNCA in LUAD. The effect of SNCA on proliferation of A549 cells were evaluated by CCK-8, EdU and colony formation. Finally, LUAD cell lines treated with 5-aza-dC were used to explore the correlation between increased promoter methylation and downregulated mRNA expression of SNCA.ResultsIn general, the expression level of SNCA in LUAD tissue was lower than that in normal tissue, and high expression of SNCA was related to better prognosis. There were significant positive correlations between SNCA expression and immune infiltrations, including CD8+ T cells, macrophages, neutrophils, dendritic cells, B cells, and CD4+ T cells, and immune checkpoints, suggesting that immune infiltration was one of the reasons for the influence of SNCA on prognosis in LUAD. The transcriptome data of A549 cells overexpressing SNCA were further used to screen the relevant immune-related genes regulated by SNCA. Enrichment analysis confirmed that SNCA participates in the PI3K-AKT signaling pathway and other key tumor signaling pathways and regulates the expression of MAPK3, SRC, PLCG1, and SHC1. Cellular proliferation assay showed that SNCA could inhabit the growth of A549 cells via inhibiting activity of PI3K/AKT/ mTOR pathway. Finally, analysis of the methylation level of SNCA promoter showed that the promoter methylation negatively correlated with mRNA level. The expression of SNCA in LUAD cell lines was significantly upregulated by treatment with 5-aza-dC.ConclusionHigh methylation of SNCA promoter in LUAD is one of the reasons for the downregulation of SNCA mRNA level. Given that SNCA could inhibit the proliferation of A549 cells and correlates with immune infiltrates, it may serve as a prognostic biomarker in LUAD.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.