NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Arka planlarEkzomlar, uzun kodlamayan RNA'lar (incRNA'lar) da dahil olmak üzere çeşitli transkript türleri içerir ve insan hastalıklarında önemli etkiler gösterdiği gösterilmiştir. Bununla birlikte, tip 1 diabetes mellitus (T1DM) 'deki ekzomal RNA'ların rolleri iyi araştırılmamıştır. Bu çalışmada, T1DM'nin plazma türevli ekzozomal lncRNAs ekspresyon profillerini karakterize ettik ve T1DM'nin patogenezindeki potansiyel işlevlerini tahmin ettik.Materyal ve yöntemlerExozomal lncRNA ekspresyon profilleri Illumina Hiseq platformu tarafından tespit edildi (T1DM denekleri N = 10; yaş-, cinsiyet eşleştirilmiş Kontrol denekleri N = 10). Altı ekzozomal lncRNA, nicel gerçek zamanlı PCR (qRT-PCR) kullanarak ifade seviyelerini doğrulamak için seçildi (T1DM denekleri N=30; yaş-, cinsiyet eşleştirilmiş Kontrol denekleri N=30). Biyoinformatik analiz yaklaşımları, diferansiyel olarak ifade edilen lncRNA'ların potansiyel biyolojik fonksiyonunu araştırmak için gerçekleştirildi.Sonuçlar Toplam 162 diferansiyel olarak ifade edilen ekzozomal lncRNA'lar, kontrol deneklerine kıyasla T1DM hastalarında tanımlanmıştır ve bunların 77'si yukarı-düzenlenmiş ve 85'i aşağı-düzenlenmiştir. Seçilen altı lncRNA'nın ifade seviyesi, aşağıdaki qRT-PCR analizinde önemli bir fark göstermedi. Gen Ontolojisi analizi, fosfolipaz D aktivitesinin aktivasyonu, nöronal hücre vücut zarı ve kalsiyum duyarlı guanylat siklaz aktivatör aktivitesi gibi terimleri zenginleştirdi. En zenginleştirilmiş Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes pathways for the lincRNAs, oksidatif fosforilasyon ve Parkinson hastalığı ile ilişkiliydi. cis-etkileyici genler için kanserde yollar ve trans-etkileyici genler için odak yapışması.Bu çalışma, T1DM'den plazma kaynaklı ekzomların lncRNA profillerini ilk kez karakterize etti ve bu sonuçlar, T1DM'deki potansiyel rolü vurguladı. Ekzozomal lncRNA profillemesinin daha iyi anlaşılması, moleküler mekanizmaları hakkında yeni bilgiler sağlayacaktır.
Özgün kaynak özetini okuyun
BackgroundsExosomes contain several types of transcripts, including long non-coding RNAs (lncRNAs), and have been shown to exert important effects in human diseases. However, the roles of exosomal lncRNAs in type 1 diabetes mellitus (T1DM) have not been well investigated. In the present study, we characterized the plasma-derived exosomal lncRNAs expression profiles of T1DM and predict their potential function in the pathogenesis of T1DM.Material and methodsExosomal lncRNA expression profiles were detected by Illumina Hiseq platform (T1DM subjects N=10; age-, sex- matched Control subjects N=10). Six exosomal lncRNAs were selected to validate their expression level by using quantitative real-time PCR (qRT-PCR) (T1DM subjects N=30; age-, sex- matched Control subjects N=30). Bioinformatics analysis approaches were carried out to explore the potential biological function of differentially expressed lncRNAs.ResultsA total of 162 differentially expressed exosomal lncRNAs were identified in T1DM patients compared with control subjects, among which 77 up-regulated and 85 down-regulated. The expression level of the selected six lncRNAs didn't show significant difference in the following qRT-PCR analysis. Gene Ontology analysis enriched terms such as activation of phospholipase D activity, neuronal cell body membrane, and calcium sensitive guanylate cyclase activator activity for cis-acting genes of lncRNAs, and metal ion binding for trans-acting genes. The most enriched Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes pathways for the lncRNAs were associated with oxidative phosphorylation and Parkinson's disease for cis-acting genes, and pathways in cancer as well as focal adhesion for trans-acting genes.ConclusionsThis study characterized the lncRNA profiles of plasma-derived exosomes from T1DM for the first time and these results highlighted the potential role of exosomal lncRNAs in T1DM pathogenesis. A better understanding of exosomal lncRNA profiling will provide novel insights into its molecular mechanisms.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.