NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Parkinson hastalığı (PD) ilerleyici bir nörodejeneratif hastalıktır. Dairesel RNA'ların (dairesel RNA'ların) çeşitli nörolojik hastalıklarda önemli rol oynadığı bildirilmiştir. Bununla birlikte, PD'deki circRNA'ların rolü ve düzenleyici ağları hala büyük ölçüde belirsizdir. Bu çalışmada, ilk olarak PD'li hastalardan circRNA'ların küresel ekspresyon seviyesini ve mikroarray kullanarak kontrolleri karşılaştırdık, daha sonra aday circRNA'lar başka bir PD kohortunda doğrulandı. Bu aday circRNA'ların olası işlevleri, Gene Ontoloji (GO) analizleri ve Kyoto Genler ve Genomlar Ansiklopedisi (KEGG) analizleri kullanılarak analiz edildi ve bu aday circRNA'ların düzenleyici ağları circRNA-miRNA-mRNA düzenleyici ağları, protein protein-protein etkileşimi (PPI) ağları ve transkripsiyon faktör-circRNA ağları aracılığıyla inşa edildi. Sonuçlar, hsa_circRNA_101275, hsa_circRNA_103730 ve hsa_circRNA_038416'nın PD'li hastalarda anlamlı olarak daha fazla ifade edildiğini, hsa_circRNA_102850'nin kontrollerle karşılaştırıldığında PD'li hastalarda daha düşük ifade edildiğini göstermiştir. Dört diferansiyel olarak ifade edilen circRNA'yı birleştiren bir circRNA paneli, PD'li hastaları kontrollerden ayırt etmek için yüksek bir tanı yeteneği gösterdi (AUC = 0.938). Dahası, GO ve KEGG analizi, bu aday circRNA'ların PI3K-Akt ve MAPK sinyal yollarında zenginleştiğini gösterdi. SirkRNA-miRNA-mRNA düzenleyici ağları kurduk ve 10 hub genini (ESR1, PTEN, SHC1, IGF1R, SMAD2, KRAS, MDM2, HIF1A, BMP4 ve ACVR2B) PPI ağ analizi kullanarak PD ile yakından ilişkili olarak tanımladık. Ayrıca, bu circRNA'ların GATA2 ve GATA3 gibi tirozin hidroksilaz (TH)-ilişkili transkripsiyon faktörleri ile düzenleneceği öngörülmüştür. Sonuç olarak, sonuçlarımız circRNA panelinin ve yerleşik circRNA-miRNA-mRNA düzenleme ağlarının PD için potansiyel yeni biyobelirteçler ve terapötik hedefler sağlayabileceğini göstermektedir.
Özgün kaynak özetini okuyun
Parkinson's disease (PD) is a progressive neurodegenerative disease. It has been reported that circular RNAs (circRNAs) play important roles in several neurological diseases. However, the role and regulatory networks of circRNAs in PD are still largely unclear. In this study, we first compared the global expression level of circRNAs from patients with PD and controls using microarray, then the candidate circRNAs were validated in another PD cohort. The possible functions of these candidate circRNAs were analyzed using Gene Ontology (GO) analyses and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) analyses, and the regulatory networks of these candidate circRNAs were constructed through circRNA-miRNA-mRNA regulatory networks, protein-protein interaction (PPI) networks, and transcription factor-circRNA networks. The results indicated that hsa_circRNA_101275, hsa_circRNA_103730, and hsa_circRNA_038416 were significantly more highly expressed in patients with PD, while hsa_circRNA_102850 was lower expressed in patients with PD when compared with controls. A circRNA panel combining the four differentially expressed circRNA showed a high diagnostic ability to distinguish patients with PD from controls (AUC = 0.938). Furthermore, GO and KEGG analysis showed these candidate circRNAs were enriched in PI3K-Akt and MAPK signaling pathways. We established circRNA-miRNA-mRNA regulatory networks and identified 10 hub genes (ESR1, PTEN, SHC1, IGF1R, SMAD2, KRAS, MDM2, HIF1A, BMP4, and ACVR2B) were closely related to PD by using PPI network analysis. Besides, these circRNAs were predicted to be regulated through tyrosine hydroxylase (TH)-relevant transcription factors such as GATA2 and GATA3. In conclusion, our results suggest that the circRNA panel and the established circRNA-miRNA-mRNA regulation networks might provide potential novel biomarkers and therapeutic targets for PD.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.