NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Arka planDNA barkodlama, basitliği ve sıkıştırmadaki üst düzey doğruluğuna göre tür tanımlamasını, taksonun morfolojik tanımlanmasına bağlı karmaşıklık ve öznel önyargılara göre kolaylaştırmak için bir araç olarak kabul edilmiştir. Kloroplastın MaturaseK geni (MatK geni), II grubu intron ekine dahil olan bitki sisteminde çok önemlidir. Bu çalışmanın temel amacı, 15 baklagilde barkodlama için "MatK" kloroplast geninin göreli yararını, taksonun morfolojik tanımlanmasına bağlı basitlik ve yüksek seviye doğruluğuna dayalı bir araç olarak belirlemektir.Metodlar ve sonuçlarMatK gen dizileri GenBank'a sunuldu ve katılım numaraları 730 ila 1545 nükleotid arasında değişen dizi uzunluğu ile elde edildi. Bu DNA dizileri PROMALS sunucusu, Clustal Omega sunucusu ve Bioedit programı kullanılarak veritabanı dizisi ile hizalandı. Filogeni inşa etmek için maksimum olasılık ve komşuya bitişik algoritmalar kullanıldı. Genel olarak, bu sonuçlar, filogenetik ağaç analizinin ve her bir türün bireysel bir veri kümesinin evrimsel mesafelerinin, iki kladdan oluşan, ilk klad (Enterolobium contortisiliqum, Albizia lebbek), Acacia saligna, Leucaena leucocephala, Dichrostachy Cinerea, (Delontachy Cinerea, Geri kalan dört tür Erythrina humeana, (Sophora secundiflora, Dalbergia Sissoo, Tipuana Tipu) ikinci kladeyi oluşturdu.Ayrıca, dizileri tek nükleotid polimorfizmde veya DNA parça analizi olarak bitki sistematik polimeraz zincir reaksiyonu kullanılarak başarıyla kullanılabilir. Bu nedenle, MatK geni, bitki ailesi Fabaceae'de DNA barkodlama için bir aday vaat ettiği ve aileler arasında net bir ilişki sağladığı kabul edilir.
Özgün kaynak özetini okuyun
BackgroundDNA barcoding have been considered as a tool to facilitate species identification based on its simplicity and high-level accuracy in compression to the complexity and subjective biases linked to morphological identification of taxa. MaturaseK gene (MatK gene) of the chloroplast is very vital in the plant system which is involved in the group II intron splicing. The main objective of this study is to determine the relative utility of the "MatK" chloroplast gene for barcoding in 15 legume as a tool to facilitate species identification based on their simplicity and high-level accuracy linked to morphological identification of taxa.Methods and resultsMatK gene sequences were submitted to GenBank and the accession numbers were obtained with sequence length ranging from 730 to 1545 nucleotides. These DNA sequences were aligned with database sequence using PROMALS server, Clustal Omega server and Bioedit program. Maximum likelihood and neighbor-joining algorithms were employed for constructing phylogeny. Overall, these results indicated that the phylogenetic tree analysis and the evolutionary distances of an individual dataset of each species were agreed with a phylogenetic tree of all each other consisting of two clades, the first clade comprising (Enterolobium contortisiliquum, Albizia lebbek), Acacia saligna, Leucaena leucocephala, Dichrostachys Cinerea, (Delonix regia, Parkinsonia aculeata), (Senna surattensis, Cassia fistula, Cassia javanica) and Schotia brachypetala were more closely to each other, respectively. The remaining four species of Erythrina humeana, (Sophora secundiflora, Dalbergia Sissoo, Tipuana Tipu) constituted the second clade.ConclusionMoreover, their sequences could be successfully utilized in single nucleotide polymorphism or as part of the sequence as DNA fragment analysis utilizing polymerase chain reaction in plant systematic. Therefore, MatK gene is considered promising a candidate for DNA barcoding in the plant family Fabaceae and provides a clear relationship between the families.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.