Mitochondrial and autophagy-lysosomal pathway polygenic risk scores predict Parkinson's disease.

Araştırma özeti

Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by

Bir bireyin karmaşık bir hastalık için genetik riskinin değerlendirilmesine izin veren polijenik Risk Puanları (PRS), bir bireyin genomundaki ağırlıklı genetik risk alel sayısı olarak hesaplanırken, risk alelleri ve ağırlıkları tipik olarak genom çapında dernek çalışmalarının (GWAS) sonuçlarından türetilmiştir. Çok çeşitli uygulamalar arasında, PRS, risk altındaki bireyleri tanımlamak ve daha fazla klinik takip için seçmek için kullanılabilir. Pathway PRS, büyük hastalık yollarında yer alan genlere atanan tek nükleotitli polimorfizmlere (SNP'ler) dayanan genetik puanlardır. Bu çalışmanın amacı, Parkinson hastalığında (PD) mitokondriyal PRS (Mito PRS) ve otofaji-lizozomal PRS (ALP PRS) dahil olmak üzere iki kardinal yola karşılık gelen SNP'lere dayalı olarak inşa edilen PRS modellerinin tahmini yararını değerlendirmektir. PRS modelleri, en son PD-GWAS tarafından keşfedilen SNP'ler kullanılarak, 371 vaka ve 249 kontrol içeren tahmin veri kümesi olarak bir Alman popülasyonunda kümeleme ve depolama yöntemi kullanılarak inşa edilmiştir. Bu pathway PRS'nin PD durumunu önemli ölçüde öngördüğünü gösterdik. Ayrıca, Mito PRS'nin PD hastalarında daha sonraki başlangıç yaşı ile önemli ölçüde ilişkili olduğunu gösterdik. Sonuçlarımız, PD riskine mitokondriyal ve otofaji-lizomal yolların katkısı için toplanan kanıtlara katkıda bulunabilir ve PD hastalarının biyolojik olarak ilgili risk tabakalaşmasını kolaylaştırabilir.

Özgün kaynak özetini okuyun

Polygenic Risk Scores (PRS), which allow assessing an individuals' genetic risk for a complex disease, are calculated as the weighted number of genetic risk alleles in an individual's genome, with the risk alleles and their weights typically derived from the results of genome-wide association studies (GWAS). Among a wide range of applications, PRS can be used to identify at-risk individuals and select them for further clinical follow-up. Pathway PRS are genetic scores based on single nucleotide polymorphisms (SNPs) assigned to genes involved in major disease pathways. The aim of this study is to assess the predictive utility of PRS models constructed based on SNPs corresponding to two cardinal pathways in Parkinson's disease (PD) including mitochondrial PRS (Mito PRS) and autophagy-lysosomal PRS (ALP PRS). PRS models were constructed using the clumping-and-thresholding method in a German population as prediction dataset that included 371 cases and 249 controls, using SNPs discovered by the most recent PD-GWAS. We showed that these pathway PRS significantly predict the PD status. Furthermore, we demonstrated that Mito PRS are significantly associated with later age of onset in PD patients. Our results may add to the accumulating evidence for the contribution of mitochondrial and autophagy-lysosomal pathways to PD risk and facilitate biologically relevant risk stratification of PD patients.

Bilimsel değerlendirme

Araştırma sorusu

Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.

Yöntem ve örneklem

Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.

Temel bulgular

Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.

Sınırlılıklar

Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.

Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.