SCIENTIFIC HUB

Araştırmanın izini sürün.

SCIENTIFIC LITERATURE · MED

Aynı PRKN silmeleri olan klinik olarak uyumsuz kardeşlerden hiPSC kaynaklı dopamin nöronlarının genomik, transkriptomik ve metabolomik profilleri.

Genomic, transcriptomic, and metabolomic profiles of hiPSC-derived dopamine neurons from clinically discordant brothers with identical PRKN deletions.

Makine çevirisi · Editoryal inceleme bekliyor

NPJ Parkinsons Dis · 2022-06-29

DOI: 10.1038/s41531-022-00346-3PMID: 35768426

Open accessresearch-article; Journal ArticleKaynağa git ↗

Araştırma özeti

Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by

Daha önce, özdeş bileşik heterozigot PRKN mutasyonları taşıyan ancak önemli ölçüde farklı Parkinson Hastalığı (PD) klinik fenotipleri olan iki kardeş hakkında rapor verdik. Çocuk vakaları, PD'nin mutlaka yaşlanma ile ilişkili bir hastalık olmadığını göstermektedir. Gerçekten de, PD patogenezinin gelişimsel bir bileşeninin kanıtı birikiyor. Bu nedenle, mezensefalik dopamin nöron gelişimi ile ilgili genetik lokus da dahil olmak üzere ek genetik değiştiricilerin varlığının, iki kardeşin farklı klinik tezahürlerine potansiyel olarak katkıda bulunabileceğini varsaymıştık. İki kardeşten türetilen insan kaynaklı pluripotent kök hücreleri (hiPSC'ler) mezensefalik nöral öncü hücrelere ve erken postmitotik dopaminerjik nöronlara ayırdık ve allexome sekanslama ve transkriptomik ve metabolomik analizler yaptık. Kanonik dopamin nöron farklılaşma belirteçlerinin ekspresyonunda anlamlı bir farklılık gözlenmedi. Yine de transkriptomik analizimiz, daha ağır etkilenen kardeşin kültürlerinde üç nörogelişimsel olarak ilgili hücre yapışma molekülünün, CNTN6, CNTN4 ve CHL1 ifadesinin önemli bir düşüşünü ortaya koydu. Ek olarak, nörogelişimde rol oynadığı bilinen birkaç HLA geni de diferansiyel olarak düzenlenmiştir. Mezensefalik dopamin nöron gelişimi için çok önemli bir transkripsiyon faktörü olan EN2'nin ifadesi de diferansiyel olarak düzenlenmiştir. Dopamin metabolizması ile ilgili hücresel süreçlerdeki farklılıkları daha da belirledik. Son olarak, allexome dizilimi, transkriptomik ve metabolom verilerinin hepsi, daha önce PD ile ilişkili olan glutatyon (GSH) homeostazında farklılıklar ortaya çıkardı. Özetle, potansiyel olarak, en azından kısmen, iki kardeşin uyumsuz klinik PD sunumuna katkıda bulunabilecek genetik farklılıkları belirledik.

Özgün kaynak özetini okuyun

We previously reported on two brothers who carry identical compound heterozygous PRKN mutations yet present with significantly different Parkinson's Disease (PD) clinical phenotypes. Juvenile cases demonstrate that PD is not necessarily an aging-associated disease. Indeed, evidence for a developmental component to PD pathogenesis is accumulating. Thus, we hypothesized that the presence of additional genetic modifiers, including genetic loci relevant to mesencephalic dopamine neuron development, could potentially contribute to the different clinical manifestations of the two brothers. We differentiated human-induced pluripotent stem cells (hiPSCs) derived from the two brothers into mesencephalic neural precursor cells and early postmitotic dopaminergic neurons and performed wholeexome sequencing and transcriptomic and metabolomic analyses. No significant differences in the expression of canonical dopamine neuron differentiation markers were observed. Yet our transcriptomic analysis revealed a significant downregulation of the expression of three neurodevelopmentally relevant cell adhesion molecules, CNTN6, CNTN4 and CHL1, in the cultures of the more severely affected brother. In addition, several HLA genes, known to play a role in neurodevelopment, were differentially regulated. The expression of EN2, a transcription factor crucial for mesencephalic dopamine neuron development, was also differentially regulated. We further identified differences in cellular processes relevant to dopamine metabolism. Lastly, wholeexome sequencing, transcriptomics and metabolomics data all revealed differences in glutathione (GSH) homeostasis, the dysregulation of which has been previously associated with PD. In summary, we identified genetic differences which could potentially, at least partially, contribute to the discordant clinical PD presentation of the two brothers.

Bilimsel değerlendirme

01

Araştırma sorusu

Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.

02

Yöntem ve örneklem

Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.

03

Temel bulgular

Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.

04

Sınırlılıklar

Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.

Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.