NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Arka planProstat adenokarsinom (PRAD) ile ilişkili kemik metastazları, morbidite ve mortalitenin önde gelen bir kaynağıdır; Bununla birlikte, iyi tanısal biyobelirteçler henüz bilinmemektedir. Bu çalışmanın amacı PRAD ile ilişkili kemik metastazlarının tanı ve tedavisi için biyobelirteçler ve prognostik göstergelerin belirlenmesiydi.MetodlarThe Cancer Genome Atlas (TCGA) ve PRAD SU2C 2019 verilerinin birleştirilmesiyle PRAD kemik metastazı ile ilişkili genlerin ekspresyon farklılıkları, biyolojik fonksiyonları ve etkileşimlerinin kapsamlı bir analizini gerçekleştirdik. Gen ontolojisi zenginleştirme ve gen seti zenginleştirme analizi kullanılarak notasyon, görselleştirme ve entegre keşif gerçekleştirildi. Protein-protein etkileşim ağı STRING veritabanı kullanılarak inşa edildi ve prognostik genlerin tanı değeri alıcı-işleten-karakteristik ve Kaplan-Meier eğrileri kullanılarak doğrulandı.ResultsSix genleri (DDX47, PRL17, AS3MT, KLRK1, ISLR ve S100A8) PRAD kemik metastazları ile ilişkili olarak tanımlandı; bunlar da prognostik değere sahipti. Bunlar arasında, biyolojik süreçler için hücre dışı matriks dokusu, hücre dışı yapısal doku, steroid hormon yanıtı ve hücre oksidatif detoksifikasyonu için zenginleştirme gözlenmiştir. KEGG analizi, hücre dışı matriks reseptörleri, Parkinson hastalığı ve dilate kardiyomiyopati dahil hastalıklar ve östrojen sinyal yolları ile etkileşimlerde zenginleşme olduğunu ortaya koydu. 0,8938, 0,9885 ve 0,979 eğri değerlerinin altında yer alan alan alan, 1, 3 ve 5 yıllık genel sağkalım için zamana bağlı alıcı-işletici-karakteristik eğri analizinden elde edilen alan, dikkate alınan modelin iyi performansını doğruladı. S100A8 ekspresyonu normal prostat dokusunda tespit edilmedi ancak PRAD.Conclusions'da tespit edildi.ISLR'yi PRAD kemik metastazı için potansiyel bir biyobelirteç olarak belirledik. Dahası, prognostik değere sahip olduğu tespit edilen genler PRAD kemik metastazı için terapötik hedefler olarak hareket edebilir.
Özgün kaynak özetini okuyun
BackgroundProstate adenocarcinoma (PRAD)-related bone metastases are a leading source of morbidity and mortality; however, good diagnostic biomarkers are not known yet. The aim of this study was to identify biomarkers and prognostic indicators for the diagnosis and treatment of PRAD-associated bone metastases.MethodsBy combining the data from The Cancer Genome Atlas(TCGA) and PRAD SU2C 2019, We performed a comprehensive analysis of the expression differences, biological functions, and interactions of genes associated with PRAD bone metastasis. Annotation, visualization, and integrated discovery were accomplished through the use of gene ontology enrichment and gene set enrichment analysis. The protein-protein interaction network was constructed using the STRING database, and the diagnostic value of prognostic genes was validated using receiver-operating-characteristic and Kaplan-Meier curves.ResultsSix genes (DDX47, PRL17, AS3MT, KLRK1, ISLR, and S100A8) associated with PRAD bone metastases were identified; these had prognostic value as well. Among them, enrichment was observed for the biological processes extracellular matrix tissue, extracellular structural tissue, steroid hormone response, and cell oxidative detoxification. KEGG analysis revealed enrichment in interactions with extracellular matrix receptors, diseases including Parkinson's disease and dilated cardiomyopathy, and estrogen signaling pathways. The area under the curve values of 0.8938, 0.9885, and 0.979, obtained from time-dependent receiver-operating-characteristic curve analysis for 1, 3, and 5-year overall survival confirmed the good performance of the model under consideration. S100A8 expression was not detected in the normal prostate tissue but was detected in PRAD.ConclusionsWe identified ISLR as a potential biomarker for PRAD bone metastasis. Moreover, the genes identified to have prognostic value may act as therapeutic targets for PRAD bone metastasis.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.