NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
BackgroundLarge ölçekli Parkinson hastalığı (PD) genom çapında dernek çalışmaları (GWAS) yakın zamana kadar sadece Avrupa-atası olan denekler üzerinde yapılmıştır. Sonuç olarak, PD GWAS verileri kullanılarak inşa edilen polijenik risk puanlarının (PRS) Avrupa dışı kohortlara uygulandığında daha az tahmin edici olması muhtemeldir. Bugüne kadarki en büyük çalışmadan GWAS verilerini kullanan Metodlar, bir Latino PD kohortu için bir PD PRS (LARGE-PD'den 1497 konu) inşa ettik ve başlangıçta PD durumu ve yaşı ile ilişki için test ettik. Bağımsız bir Latin kohortunda (448 denek) test ederek ve 440 dış Peru kontrollerinin eklenmesiyle LARGE-PD'deki analizi tekrarlayarak PRS performansını doğruladık. Ayrıca SNCA haplotiplerini LARGE-PD'de PD riski ve bir Avrupa-atalar PD kohortu ile ilişkili olarak test ettik.SonuçlarGWAS-önemli PD PRS, LARGE-PD'de 0.668 (95% CI: 0.640-0.695) alıcı-operatör eğrisinin (AUC) altında bir alana sahipti. Harici Peru kontrollerinin dahil edilmesi, bu sonucu hafifletti ve AUC 0.632'yi (% 95 CI: 0.607-0.657) düşürdü. SNCA lokuslarında haplotipler atalara göre farklılık gösterir. Ataya özgü SNCA haplotipleri, hem LARGE-PD hem de Avrupa-atalet kohortunda PD durumu ile ilişkiliydi (p-değeri SonuçPD PRS, Latinlerde PD risk tahmini için potansiyele sahiptir, ancak Avrupa-atalar PD PRS verilerindeki katkı kalıplarından ve önyargıdan kaynaklanan değişkenlik, faydasını sınırlar. Çeşitli konuların dahil edilmesi, PD risk loci'yi aydınlatmaya ve Avrupalı olmayan kohortlarda risk tahminini iyileştirmeye yardımcı olabilir.
Özgün kaynak özetini okuyun
BackgroundLarge-scale Parkinson's disease (PD) genome-wide association studies (GWAS) have, until recently, only been conducted on subjects with European-ancestry. Consequently, polygenic risk scores (PRS) constructed using PD GWAS data are likely to be less predictive when applied to non-European cohorts.MethodsUsing GWAS data from the largest study to date, we constructed a PD PRS for a Latino PD cohort (1497 subjects from LARGE-PD) and tested it for association with PD status and age at onset. We validated the PRS performance by testing it in an independent Latino cohort (448 subjects) and by repeating the analysis in LARGE-PD with the addition of 440 external Peruvian controls. We also tested SNCA haplotypes for association with PD risk in LARGE-PD and a European-ancestry PD cohort.ResultsThe GWAS-significant PD PRS had an area under the receiver-operator curve (AUC) of 0.668 (95% CI: 0.640-0.695) in LARGE-PD. The inclusion of external Peruvian controls mitigated this result, dropping the AUC 0.632 (95% CI: 0.607-0.657). At the SNCA locus, haplotypes differ by ancestry. Ancestry-specific SNCA haplotypes were associated with PD status in both LARGE-PD and the European-ancestry cohort (p-value ConclusionThe PD PRS has potential for PD risk prediction in Latinos, but variability caused by admixture patterns and bias in a European-ancestry PD PRS data limits its utility. The inclusion of diverse subjects can help elucidate PD risk loci and improve risk prediction in non-European cohorts.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.